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Enregistrement W2607303732 · doi:10.1200/jco.2012.30.15_suppl.8003

Plasma viral DNA as a marker of tumor response in EBV(+) Hodgkin lymphoma in a phase III study (E2496).

2012· article· en· W2607303732 sur OpenAlexaff
Jennifer A. Kanakry, Hailun Li, Lan L. Gellert, M. Victor Lemas, Kuangwen Hsieh, King Tan, Randy D. Gascoyne, Leo I. Gordon, Sandra J. Horning, Brad S. Kahl, Richard F. Ambinder

Notice bibliographique

RevueJournal of Clinical Oncology · 2012
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueViral-associated cancers and disorders
Établissements canadiensUniversity of British ColumbiaBC Cancer Agency
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésEpstein–Barr virusLymphomaVirusMedicineViral loadIn situ hybridizationVirologyPathologyBiologyGeneMessenger RNA

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

8003 Background: Epstein-Barr virus (EBV) is associated with Hodgkin lymphoma (HL) and can be detected by in situ hybridization (ISH) of viral nucleic acid (EBER) in tumor cells. Studies have suggested a correlation in HL between plasma EBV DNA and EBER ISH. We previously studied the DNase sensitivity of plasma EBV DNA and found plasma EBV of patients with EBV(+) HL was not protected from DNase digestion, consistent with tumor-derived DNA, while plasma EBV of patients with HIV without EBV(+) tumors was protected from DNase digestion, consistent with virion DNA. We sought to determine whether plasma EBV could serve as a surrogate for EBER ISH and whether reappearance of plasma EBV predicts treatment failure. Methods: Specimens from a Cancer Cooperative Intergroup Trial (E2496/Stanford V versus ABVD for HL) were used to compare pretreatment plasma EBV DNA copy number, assessed by real-time quantitative PCR, with EBV status by EBER ISH. An ROC analysis was performed using patients with both pretreatment plasma EBV and EBER results (n=121), identifying a cutoff of 60 viral copies/100 µL plasma (95% concordance, 92% sensitivity, 96% specificity for EBV status by EBER). Using this cutoff, pretreatment plasma specimens (n=274) were designated EBV(+) (n=54) or EBV(-) (n=220), as were serial follow-up specimens. Cox proportional hazard models were constructed to evaluate plasma EBV as a prognostic factor for failure-free survival (FFS). FFS was estimated by the Kaplan-Meier method. Results: Pretreatment EBV(+) plasma was associated with treatment failure with a hazard ratio of 2.1 (95% CI 1.2-3.6, p=0.01) after adjusting for International Prognostic Score, treatment arm, and histology. Of the EBV(+) patients with follow-up specimens (n=45), patients with EBV(+) plasma beyond 1 month of therapy (n=9) had inferior FFS compared to those who cleared their plasma of EBV (n=36), (3-year FFS 44% versus 69%, respectively; log rank p=0.03). Conclusions: HL patients with EBV(+) plasma at baseline have inferior FFS compared to others. Among patients with EBV(+) plasma at baseline, those in whom plasma EBV persists or reappears after initiation of therapy have inferior FFS. Such patients may benefit from experimental or intensified therapies.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,003
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,003
Score d'incertitude au seuil0,014

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0030,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0020,001
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,001
Communication savante0,0010,001
Science ouverte0,0010,000
Intégrité de la recherche0,0010,002
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,067
Tête enseignante GPT0,462
Écart entre enseignants0,395 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations1
Publié2012
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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