Current State of PCR-Based Epstein-Barr Virus DNA Testing for Nasopharyngeal Cancer
Notice bibliographique
Résumé
Clinical studies have shown plasma Epstein-Barr virus (EBV) DNA level to be an independent prognostic biomarker for nasopharyngeal carcinoma (NPC). However, the proportion of NPC patients whose tumors are associated with EBV vary with geographic location, and there are a variety of assays for plasma EBV. To develop the level of evidence needed to demonstrate the clinical utility of plasma EBV DNA detection for NPC patients and encourage widespread adoption of this biomarker test in clinical laboratories, validated harmonized assays are needed. In 2015, the National Cancer Institute (NCI) convened a Workshop on Harmonization of EBV Testing for Nasopharyngeal Cancer, where experts in head and neck oncology and laboratory medicine addressed the limitations of currently available polymerase chain reaction-based EBV DNA quantitation assays and discussed strategies for advancing the development of harmonized EBV DNA assays and their appropriate clinical use. This article presents the key recommendations to direct future efforts in assay harmonization and validation.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,151 | 0,119 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,001 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,002 | 0,002 |
| Bibliométrie | 0,006 | 0,005 |
| Études des sciences et des technologies | 0,001 | 0,007 |
| Communication savante | 0,008 | 0,005 |
| Science ouverte | 0,009 | 0,003 |
| Intégrité de la recherche | 0,003 | 0,005 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,002 | 0,002 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».