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Enregistrement W2607445392 · doi:10.1186/s13072-017-0127-3

Fetal testis organ culture reproduces the dynamics of epigenetic reprogramming in rat gonocytes

2017· article· en· W2607445392 sur OpenAlex

Pourquoi ce travail est dans la base

Une base qui oublie comment elle a trouvé un travail ne peut pas être vérifiée. Voici les voies qui ont admis celui-ci.

affAu moins un auteur déclare une institution canadienne dans l'instantané OpenAlex épinglé.
fundUn bailleur canadien est enregistré sur le travail.

Notice bibliographique

RevueEpigenetics & Chromatin · 2017
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueSperm and Testicular Function
Établissements canadiensInstitut National de la Recherche Scientifique
Organismes subventionnairesCanadian Network for Research and Innovation in Machining Technology, Natural Sciences and Engineering Research Council of CanadaArmand-Frappier FoundationNatural Sciences and Engineering Research Council of CanadaMcGill University
Mots-clésBiologyReprogrammingGonocyteEpigeneticsDNA methylationH3K4me3Organ cultureEpigenomeCell biologyMethylationGerm cellAndrologyGeneticsGene expressionCellDNA

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Epigenetic reprogramming is a critical step in male germ cell development that occurs during perinatal life. It is characterized by the remodeling of different epigenetic marks such as DNA methylation (5mC) and methylation of histone H3. It has been suggested that endocrine disruptors can affect the male germline epigenome by altering epigenetic reprogramming, but the mechanisms involved are still unknown. We have previously used an organ culture system that maintains the development of the different fetal testis cell types, to evaluate the effects of various endocrine disruptors on gametogenesis and steroidogenesis in the rat. We hypothesize that this culture model can reproduce the epigenetic reprogramming in gonocytes. Our aim was to establish the kinetics of three epigenetic marks throughout perinatal development in rats in vivo and compare them after different culture times. Using immunofluorescence, we showed that H3K4me2 transiently increased in gonocytes at 18.5 days post-coitum (dpc), while H3K4me3 displayed a stable increase in gonocytes from 18.5 dpc until after birth. 5mC progressively increased from 20.5 dpc until after birth. Using GFP-positive gonocytes purified from GCS-EGFP rats, we established the chronology of re-methylation of H19 and Snrpn in rat gonocytes. Most importantly, using testis explanted at 16.5 or 18.5 dpc and cultured for 2–4 days, we demonstrated that the kinetics of changes in H3K4me2, H3K4me3, global DNA methylation and on parental imprints can generally be reproduced ex vivo with the model of organ culture without the addition of serum. This study reveals the chronology of three epigenetic marks (H3K4me2, H3K4me3 and 5mC) and the patterns of methylation of H19 and Snrpn differentially methylated regions in rat gonocytes during perinatal development. Most importantly, our results suggest that the organ culture can reproduce the process of epigenetic reprogramming and can be used to study the impact of environmental chemicals on the establishment of the male germ cell epigenome.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,002
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,157
Score d'incertitude au seuil0,588

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,002
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,018
Tête enseignante GPT0,280
Écart entre enseignants0,261 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle