P10.21 2-hydroxyglutarate as a biomarker for IDH mutation in low grade gliomas
Notice bibliographique
Résumé
Glioma patients continue to carry a very poor prognosis despite maximal therapy. Several genetic alterations are linked with better survival outcome in glioma patients, including mutations in isocitrate dehydrogenase 1 and 2 (IDH1/2). The product of IDH mutation is the chemical 2-hydroxyglutarate (2-HG), which is a metabolite linked to cancer development. Currently, there is no method by which we can determine the IDH status of glioma during surgery. A much-needed area of progress is the application of innovative methods to enable detection of IDH mutation intraoperatively to guide extent of resection while avoiding the need for a second high-risk cranial surgery. High performance liquid chromatography tandem mass spectrometry (HPLC-MS) was developed, validated and utilized to quantify the R-2-HG and S-2-HG enantiomers and total 2-HG levels in 38 frozen brain tumor samples (IDH WT n=14, IDH mutated n=24). Brain tumor samples were retrieved from the Toronto Western Foundation brain tumor bank. Glioma diagnosis and IDH status were determined by microscopy and immunohistochemistry. 30 patients had paired serum that was included in our analysis. Progression-free survival data for all patients was collected. We found that the R:S ratio of 2-HG within patient tumors corresponds with IDH status, with our IDH-mutant patients having an elevated R:S ratio of 1551 ± 457 in contrast to IDH-WT patients = 6.2 ± 4.4 (P<0.001). This trend was also confirmed when comparing total 2-HG levels (P<0.001). Of the patients with IDH-mutated tumors, a higher R:S ratio of 2-HG appears to be associated with worse survival, in contrast to total 2-HG levels, where there was no obvious correlation to survival. Finally, serum 2-HG levels did not correspond with IDH status. We believe the R:S 2-HG ratio can potentially be used as an intraoperative biomarker for IDH mutation detection to personalize glioma surgery.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,001 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».