MétaCan
Menu
Retour à la cohorte
Enregistrement W2608619021 · doi:10.1139/gen-2016-0189

Identification of quantitative trait loci underlying seed protein content of soybean including main, epistatic, and QTL × environment effects in different regions of Northeast China

2017· article· en· W2608619021 sur OpenAlexvenueno aff
Weili Teng, Wen Li, Qi Zhang, Depeng Wu, Xue Zhao, Haiyan Li, Yingpeng Han, Wenbin Li

Notice bibliographique

RevueGenome · 2017
Typearticle
Langueen
DomaineAgricultural and Biological Sciences
ThématiqueSoybean genetics and cultivation
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésQuantitative trait locusEpistasisBiologyInbred strainGeneticsPopulationInteractionGeneAgronomy

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

The objective here was to identify QTL underlying soybean protein content (PC), and to evaluate the additive and epistatic effects of the QTLs. A mapping population, consisting of 129 recombinant inbred lines (RILs), was created by crossing 'Dongnong 46' and 'L-100'. Phenotypic data of the parents and RILs were collected for 4 years in three locations of Heilongjiang Province of China. A total of 213 SSR markers were used to construct a genetic linkage map. Eight QTLs, located on seven chromosomes (Chr), were identified to be associated with PC among the 10 tested environments. Of the seven QTLs, five QTLs, qPR-2 (Satt710, on Chr9), qPR-3 (Sat_122, on Chr12), qPR-5 (Satt543, on Chr17), qPR-7 (Satt163, on Chr18), and qPR-8 (Satt614, on Chr20), were detected in six, seven, seven, six, and seven environments, respectively, implying relatively stable QTLs. qPR-3 could explain 3.33%-11.26% of the phenotypic variation across eight tested environments. qPR-5 and qPR-8 explained 3.64%-10.1% and 11.86%-18.40% of the phenotypic variation, respectively, across seven tested environments. Eight QTLs associated with PC exhibited additive and (or) additive × environment interaction effects. The results showed that environment-independent QTLs often had higher additive effects. Moreover, five epistatic pairwise QTLs were identified in the 10 environments.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,938
Score d'incertitude au seuil0,150

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,071
Tête enseignante GPT0,259
Écart entre enseignants0,188 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations16
Publié2017
Routes d'admission1
Résumé présentoui

Explorer davantage

Même revueGenomeMême sujetSoybean genetics and cultivationTravaux en français237 207