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Enregistrement W2608708126 · doi:10.3389/fmicb.2017.00751

Drosophila melanogaster as a High-Throughput Model for Host–Microbiota Interactions

2017· article· en· W2608708126 sur OpenAlexafffund
Mark Trinder, Brendan A. Daisley, Josh S. Dube, Gregor Reid

Notice bibliographique

RevueFrontiers in Microbiology · 2017
Typearticle
Langueen
DomaineAgricultural and Biological Sciences
ThématiqueInsect symbiosis and bacterial influences
Établissements canadiensWestern UniversitySt Joseph's Health CareLawson Health Research Institute
Organismes subventionnairesNatural Sciences and Engineering Research Council of CanadaGovernment of Canada
Mots-clésDrosophila melanogasterHost (biology)BiologyThroughputDrosophila (subgenus)Evolutionary biologyComputational biologyGeneticsComputer scienceGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

We agree no model is perfect and that D. melanogaster has its limitations like any other model. We would like to stress that we are not discrediting germ-free mouse models, but that researchers could benefit from supportive in vivo evidence (rather than in vitro) of their hypotheses before embarking down this expensive avenue. The cost and time-consuming nature of germ-free mouse studies requires strong conviction of hypotheses to warrant logical further investigation. The purpose of this perspective article is to bring attention to the under-considered areas of research that D. melanogaster may be a useful model for preliminary investigations. We highlight that the inexpensive and high-throughput D. melanogaster microbiota model can enable investigators to experiment with exploratory research questions such as probiotics, prebiotics, xenobiotics, and diet-genetic interactions before verification in costlier models. D. melanogaster microbiota simplicity also enables researchers to develop predictive models of how polymicrobial interactions affect host physiology before testing in more complex hosts (a common theme in biological animal models which you have alluded to previously). Altogether, we agree that there are limitations to the D. melanogaster model. We have now explicitly pointed out the major shortcomings of this model in the Future Directions and Conclusions section and made reference to review articles addressing these limitations in more detail. We hope this will better inform readers while also abiding to the strict space limitations inherent of perspective articles.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,589
Score d'incertitude au seuil0,426

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0010,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0010,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,020
Tête enseignante GPT0,250
Écart entre enseignants0,230 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations92
Publié2017
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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