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Enregistrement W2609262574 · doi:10.1093/sleep/zsx068

Tissue-Specific Dissociation of Diurnal Transcriptome Rhythms During Sleep Restriction in Mice

2017· article· en· W2609262574 sur OpenAlexaff
Jana Husse, Jana‐Thabea Kiehn, Johanna L. Barclay, Nadine Naujokat, Judit Meyer-Kovac, Hendrik Lehnert, Henrik Oster

Notice bibliographique

RevueSLEEP · 2017
Typearticle
Langueen
DomaineNeuroscience
ThématiqueCircadian rhythm and melatonin
Établissements canadiensHospital for Sick Children
Organismes subventionnairesDeutsche Forschungsgemeinschaft
Mots-clésTranscriptomeCLOCKEndocrinologyBiologyCircadian rhythmInternal medicinePER2Sleep restrictionPER1Suprachiasmatic nucleusCircadian clockGene expressionGeneSleep deprivationGeneticsMedicine

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Study objectives: Shortened or mistimed sleep affects metabolic homeostasis, which may in part be mediated by dysregulation of endogenous circadian clocks. In this study, we assessed the contribution of sleep disruption to metabolic dysregulation by analysing diurnal transcriptome regulation in metabolic tissues of mice subjected to a sleep restriction (SR) paradigm. Methods: Male mice were subjected to 2 × 5 days of SR with enforced waking during the first 6 hours of the light phase. SR and control mice were sacrificed at different time points of the day and RNA preparations from the mediobasal hypothalamus (MBH), liver, and epididymal white adipose tissue (eWAT) were subjected to whole-genome microarray hybridization. Transcriptional rhythms were associated with changes in behavioral and physiological parameters such as sleep, body temperature, and food intake. Rhythm detection was performed with CircWave and transcription profiles were compared by 2-way analysis of variance and t-tests with Benjamini-Hochberg corrections. Results: Clock gene rhythms were blunted in all tissues, while transcriptome regulation was associated with either clock gene expression, sleep patterns, or food intake in a tissue-specific manner. Clock gene expression was associated with apoptosis pathways in the MBH and with tumor necrosis factor alpha signalling in liver. Food intake-associated genes included cilium movement genes in the MBH and lipid metabolism-associated transcripts in liver. Conclusions: In mice, repeated SR profoundly alters behavioral and molecular diurnal rhythms, disrupting essential signalling pathways in MBH, liver, and eWAT, which may underlie the metabolic and cognitive disturbances observed in sleep-restricted humans such as shift workers.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,467
Score d'incertitude au seuil0,475

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,026
Tête enseignante GPT0,266
Écart entre enseignants0,241 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations37
Publié2017
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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