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Enregistrement W2609352621 · doi:10.1096/fasebj.22.1_supplement.757.1

Evolutionary and functional variation of PGC‐1α in vertebrates

2008· article· en· W2609352621 sur OpenAlexaffabout
Christophe M. R. Le Moine, Christine E. Genge, Stephen E. Lougheed, Christopher D. Moyes

Notice bibliographique

RevueThe FASEB Journal · 2008
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueMitochondrial Function and Pathology
Établissements canadiensQueen's University
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésBiologyVertebrateRegulatorPhylogeneticsOxidative phosphorylationCell biologyConserved sequenceMitochondrionSerineGeneticsEvolutionary biologyGeneBiochemistryPeptide sequence

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

In mammals, PGC‐1α is a central regulator of oxidative metabolism through its interactions with NRF‐1 and the PPARs. We examined the role of PGC‐1α in the evolution and development of physiological variations in vertebrates’ oxidative capacity. First, we sought to determine the regulators of the temperature and dietary‐induced metabolic remodeling in goldfish. NRF‐1 and PPARα, respectively, had typical roles in orchestrating mitochondrial proliferation and fatty acid oxidation. In contrast, while goldfish PGC‐1α seemed to be involved in the regulation of the PPAR axis, it did not appear to play a role in NRF‐1 dependent mitochondrial proliferation. To assess the structural basis of these divergent roles in mammals and fish, we investigated the evolutionary trajectory of PGC‐1α in representative vertebrate lineages. The analysis revealed a good conservation of the activation/PPAR interaction domain across vertebrates, whereas the NRF‐1 interaction domain experienced accelerated rates of evolution in Actinopterygians (fish lineages) compared to Sarcopterygians (tetrapod lineages). Furthermore, protein sequence analysis of this variable domain in lineages giving rise to modern teleosts revealed successive serine and glutamine residues insertions with important functional repercussions on PGC‐1α control of mitochondrial proliferation in teleosts. Funded by NSERC (Canada).

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,002
Score d'incertitude au seuil0,003

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0010,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,015
Tête enseignante GPT0,215
Écart entre enseignants0,200 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2008
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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