MétaCan
Menu
Retour à la cohorte
Enregistrement W2609507751 · doi:10.3389/fmicb.2017.00722

Ecological Stoichiometry beyond Redfield: An Ionomic Perspective on Elemental Homeostasis

2017· article· en· W2609507751 sur OpenAlexfundno aff
Punidan D. Jeyasingh, Jared M. Goos, Seth Thompson, Casey M. Godwin, James B. Cotner

Notice bibliographique

RevueFrontiers in Microbiology · 2017
Typearticle
Langueen
DomaineChemistry
ThématiqueElectrochemical Analysis and Applications
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesTrent UniversityNational Science Foundation
Mots-clésStoichiometryEcologyBiologyEcological stoichiometryPerspective (graphical)ChemistryEcosystemComputer sciencePhysical chemistry

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Elemental homeostasis has been largely characterized using three important elements that were part of the Redfield ratio (i.e., carbon: nitrogen: phosphorus). These efforts have revealed substantial diversity in homeostasis among taxonomic groups and even within populations. Understanding the evolutionary basis, and ecological consequences of such diversity is a central challenge. Here, we propose that a more complete understanding of homeostasis necessitates the consideration of other elements beyond C, N, and P. Specifically, we posit that physiological complexity underlying maintenance of elemental homeostasis along a single elemental axis impacts processing of other elements, thus altering elemental homeostasis along other axes. Indeed, transcriptomic studies in a wide variety of organisms have found that individuals differentially express significant proportions of the genome in response to variability in supply stoichiometry in order to maintain varying levels of homeostasis. We review the literature from the emergent field of ionomics that has established the consequences of such physiological trade-offs on the content of the entire suite of elements in an individual. Further, we present experimental data on bacteria exhibiting divergent phosphorus homeostasis phenotypes demonstrating the fundamental interconnectedness among elemental quotas. These observations suggest that physiological adjustments can lead to unexpected patterns in biomass stoichiometry, such as correlated changes among suites of non-limiting microelements in response to limitation by macroelements. Including the entire suite of elements that comprise biomass will foster improved quantitative understanding of the links between chemical cycles and the physiology of organisms.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,037
Score d'incertitude au seuil0,587

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0010,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,008
Tête enseignante GPT0,271
Écart entre enseignants0,262 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations63
Publié2017
Routes d'admission1
Résumé présentoui

Explorer davantage

Même revueFrontiers in MicrobiologyMême sujetElectrochemical Analysis and ApplicationsTravaux en français237 207