Single nucleotide polymorphisms (SNPs) of the platinum pharmacogenetic and VEGF pathways: Association with survival of platinum-treated stage IV non-small cell lung cancer (NSCLC) patients.
Notice bibliographique
Résumé
7586 Background: Two potentially important host pathways in lung cancer systemic therapy are: (i) the pharmacogenetic pathway of platinum agents (DNA repair, metabolism, and multidrug resistance genes); and (ii) the vascular endothelial growth factor (VEGF) pathway. We investigated the relationship between SNPs in these two pathways and clinical outcome in platinum-treated NSCLC patients. Methods: 188 platinum-treated Stage IV NSCLC patients underwent SNP genotyping for the platinum-related (48 SNPs in 7 genes) and VEGF (64 SNPs in 3 genes) pathways. SNPs were selected from the literature and through tagging. Association of SNPs and overall (OS) and progression free survival (PFS) were assessed using multivariate Cox proportional hazards models. Results: 72% were Caucasian; 73%, adenocarcinoma; 92%, ECOG PS 0-1; median age, 60 years; 54% received > one line of systemic therapy; 10% received anti-VEGF therapy/placebo; Median OS, 1.3 yrs; median follow up, 2.2 yrs. The top significant SNPs in the platinum-related pathway were in ABCC2 (rs8187710 and rs2756109, r2=0.68). The G variants of the top SNP, ABCC2 rs8187710 (4554G>A), were associated with worse OS (adjusted hazard ratio [aHR], 2.62; 95%CI: 1.5-4.5; p=0.0005) and PFS (aHR, 1.97; 95%CI: 1.2-3.4; p=0.01). Functionally, 4554G>A impairs ATP-ase activity and is associated with higher cellular accumulation of ABCC2 substrates [PMID: 22027652]; furthermore, ABCC2 expression is associated with cisplatin resistance and clinical outcome in other cancers [PMID: 17145840]. Within the VEGF pathway, the top significant SNPs were in the same haplotype block of VEGFR1/FLT1 (rs1324057, rs7324547, r2=1.0): for rs1324057, the aHR for OS was 1.59 (95%CI 1.2-2.1); p=0.001; and the aHR for PFS, 1.48 (95%CI 1.1-1.9); p=0.004. VEGFR1/FLT1 rs7324547 has been associated with esophageal cancer risk [PMID: 21751195], but has not been assessed in lung cancer. Conclusions: SNPS of the VEGFR1 and ABCC2 genes are strongly associated with OS and PFS in this cohort of platinum-treated advanced NSCLC patients. Future studies should assess whether these are predictive or prognostic markers.
Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.
Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».