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Enregistrement W2610753795 · doi:10.1111/apt.14092

Misbalance in type <scp>III</scp> collagen formation/degradation as a novel serological biomarker for penetrating (Montreal B3) Crohn's disease

2017· article· en· W2610753795 sur OpenAlexaboutno aff
Wouter T. van Haaften, Joachim Høg Mortensen, M.A. Karsdal, Anne‐Christine Bay‐Jensen, Gerard Dijkstra, Peter Olinga

Notice bibliographique

RevueAlimentary Pharmacology & Therapeutics · 2017
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueInflammatory Bowel Disease
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesZonMw
Mots-clésMedicineBiomarkerSerologyCrohn's diseaseDiseaseImmunologyPathologyAntibodyBiochemistryChemistry

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

BACKGROUND: Misbalances in extracellular matrix turnover are key factors in the development of stricturing (Montreal B2) and penetrating (Montreal B3) Crohn's disease. AIM: To determine whether serological markers for collagen formation and degradation could serve as biomarkers for complications of Crohn's disease. METHODS: Serum biomarkers for type I, III, V and VI collagen formation (P1NP, Pro-C3, Pro-C5, Pro-C6) and matrix metalloproteinase mediated degradation (C1M, C3M, C5M and C6M) were measured in a retrospective, single centre cohort of 112 patients with Crohn's disease in the terminal ileum (nonstricturing/nonpenetrating: n=40, stricturing: n=55, penetrating: n=17) and 24 healthy controls. Active inflammation was defined as CRP >5 mg/L. RESULTS: C3M and Pro-C5 levels were higher in penetrating vs nonpenetrating/nonstricturing and stricturing disease (33.6±5 vs 25.8±2.2 [P=.004] and 27.2±2.3 [P=.018] nmol/L C3M, 1262.7±259.4 vs 902.9±109.9 [P=.005] and 953.0±106.4 [P=.015] nmol/L Pro-C5). C1M (71.2±26.1 vs 46.2±6.2 nmol/L [P<.001]), C3M (31.6±3.9 vs 26.1±1.6 nmol/L [P=.002] and Pro-C5 levels (1171.7±171.5 vs 909.6±80.4 nmol/L [P=.002]) were higher in patients with active inflammation vs without active inflammation. Pro-C3/C3M-ratios were best to differentiate between penetrating vs nonstricturing/nonpenetrating and stricturing disease with area under the curves of 0.815±0.109 (P<.001) and 0.746±0.114 (P=.002) respectively. CONCLUSIONS: Serological biomarkers show that penetrating Crohn's disease is characterised by increased matrix metalloproteinase-9 degraded type III collagen and formation of type V collagen. Active inflammation in Crohn's disease is characterised by increased formation of type V collagen and increased matrix metalloproteinase mediated breakdown of type I, III collagen. Pro-C3/C3M ratios are superior in differentiating between penetrating Crohn's disease vs inflammatory and stricturing Crohn's disease.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,004

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0010,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0010,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,037
Tête enseignante GPT0,327
Écart entre enseignants0,291 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations66
Publié2017
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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