Population structure in chicory (<i>Cichorium intybus</i>): A successful U.S. weed since the American revolutionary war
Notice bibliographique
Résumé
Abstract Plant invasions are recognized as major drivers of ecosystem change, yet the precise cause of these invasions remains unknown for many species. Frequency and modes of introductions during the first, transport and colonization, stages of the invasion process as well as phenotypic changes due to plasticity or changing genetic diversity and adaptation during later establishment and expansion stages can all influence the “success” of invasion. Here, we examine some of these factors in, and the origin of, a very successful weed, Cichorium intybus (chicory) which was introduced to North America in the 18th century and which now can be found in all 48 continental U.S. states and much of Canada. We genotyped a Eurasian collection of 11 chicory cultivars, nine native populations and a North American collection of 20 introduced wild populations which span the species range (592 individuals in total). To detect the geographic sources of North American chicory populations and to assess the genetic diversity among cultivars, native, and introduced populations, we used both a sequenced cp DNA region and 12 nuclear simple sequence repeat ( SSR ), microsatellite loci. Four cp DNA haplotypes were identified and revealed clear geographic subdivisions in the chicory native range and an interspecific hybrid origin of Radicchio group. Nuclear data suggested that domesticated lines deliberately introduced to North America were major contributors to extant weedy populations, although unintended sources such as seed contaminants likely also played important roles. The high private allelic richness and novel genetic groups were detected in some introduced populations, suggesting the potential for local adaptation in natural sites such as deserts and nature reserves. Our findings suggest that the current populations of weedy U.S. chicory have evolved primarily from several sources of domesticated and weedy ancestors and subsequent admixture among escaped lineages.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,001 | 0,001 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».