Gene expression patterns in the progression of canine copper-associated chronic hepatitis
Notice bibliographique
Résumé
Copper is an essential trace element, but can become toxic when present in abundance. The severe effects of copper-metabolism imbalance are illustrated by the inherited disorders Wilson disease and Menkes disease. The Labrador retriever dog breed is a novel non-rodent model for copper-storage disorders carrying mutations in genes known to be involved in copper transport. Besides disease initiation and progression of copper accumulation, the molecular mechanisms and pathways involved in progression towards copper-associated chronic hepatitis still remain unclear. Using expression levels of targeted candidate genes as well as transcriptome micro-arrays in liver tissue of Labrador retrievers in different stages of copper-associated hepatitis, pathways involved in progression of the disease were studied. At the initial phase of increased hepatic copper levels, transcriptomic alterations in livers mainly revealed enrichment for cell adhesion, developmental, inflammatory, and cytoskeleton pathways. Upregulation of targeted MT1A and COMMD1 mRNA shows the liver's first response to rising intrahepatic copper concentrations. In livers with copper-associated hepatitis mainly an activation of inflammatory pathways is detected. Once the hepatitis is in the chronic stage, transcriptional differences are found in cell adhesion adaptations and cytoskeleton remodelling. In view of the high similarities in copper-associated hepatopathies between men and dog extrapolation of these dog data into human biomedicine seems feasible.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».