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Enregistrement W2611168687 · doi:10.25011/cim.v30i4.2860

Genetic characterization of two autosomal recessive disorders, Majewski-like and cerebral atrophy syndromes

2007· article· en· W2611168687 sur OpenAlexvenueaboutno aff
Piya Lahiry, John F. Robinson, Victoria Mok Siu, Erik G. Puffenberger, K. Strauss, R A Hegele, C. Anthony Rupar

Notice bibliographique

RevueClinical and investigative medicine · 2007
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueGenetic and Kidney Cyst Diseases
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésGeneticsLocus (genetics)BiologyCandidate geneMicrocephalyCerebral atrophyPsychomotor retardationPolydactylyDisease gene identificationPopulationAtrophyMedicineGenePathologyMutationExome sequencing

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Introduction: We recently identified two lethal recessive disorders segregating within the same Old Order Amish pedigree. The first disorder, Majewski-like syndrome (MLS), has features that overlap with both Majewski short rib-polydactyly syndrome and hydrolethalus syndrome. MLS is a lethal multi-system disorder that affects the development of the brain, adrenal glands, pituitary gland and bone. The second disorder, cerebral atrophy syndrome (CAS), is characterized by progressive and global loss of brain tissue. Affected children present early in life with microcephaly, seizures, and psychomotor retardation, and possess distinctive MRI findings. The objective of this study was to identify the genetic bases of these disorders to provide prompt and reliable diagnosis for families. Methods: Assuming recessive inheritance and mutation homogeneity (autozygosity), we used Affymetrix 10,000-single nucleotide polymorphism (10K-SNP) to genotype all affected individuals and identify candidate regions. SNP data were analyzed using Agilent GT autozygosity mapping software. LOD scores were used to identify candidate regions, and genes within these regions were prioritized for sequencing. Results and Conclusion: Because the Ontario Anabaptist population is relatively small, genetically isolated, and historically young, we were able to robustly map candidate regions using relatively low marker density and only a few affected individuals. Our preliminary data is consistent with the clinical observation that MLS and CAS segregate independently, as recessive conditions, within the pedigree. Thus far, we have sequenced 12 genes within the MLS locus, all of which were normal. For CAS, autozygosity mapping yielded two loci with comparable linkage scores, one of which contained no observable mutations. Once the causative mutations have been identified for MLS and CAS, we intend to study their population frequencies and also to pursue in vitro studies of gene and protein functions.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,083
Score d'incertitude au seuil0,166

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0010,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,037
Tête enseignante GPT0,307
Écart entre enseignants0,271 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2007
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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