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Enregistrement W2611345033 · doi:10.3747/co.24.3395

Uptake of a 21-Gene Expression Assay in Breast Cancer Practice: Views of Academic and Community-Based Oncologists

2017· article· en· W2611345033 sur OpenAlexaffvenueabout
Mary Ann O’Brien, Sukhbinder Dhesy‐Thind, Cathy Charles, Melanie Hammond Mobilio, Natasha B. Leighl, Eva Grunfeld

Notice bibliographique

RevueCurrent Oncology · 2017
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueBRCA gene mutations in cancer
Établissements canadiensPrincess Margaret Cancer CentreThe Wilson CentreOntario Institute for Cancer ResearchMcMaster UniversityUniversity of Toronto
Organismes subventionnairesNational Comprehensive Cancer Network
Mots-clésMedicineBreast cancerGene expressionCommunity practiceBioinformaticsGeneCancerComputational biologyOncologyCancer researchFamily medicineInternal medicineGeneticsBiology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

PURPOSE: Advances in personalized medicine have produced novel tests and treatment options for women with breast cancer. Relatively little is known about the process by which such tests are adopted into oncology practice. The objectives of the present study were to understand the experiences of medical oncologists with multigene expression profile (gep) tests, including their adoption into practice in early-stage breast cancer, and the perceptions of the oncologists about the influence of test results on treatment decision-making. METHODS: We conducted a qualitative descriptive study involving interviews with medical oncologists from academic and community cancer centres or hospitals in 8 communities in Ontario. A 21-gene breast cancer assay was used as the example of gep testing. Qualitative analytic techniques were used to identify the main themes. RESULTS: Of 28 oncologists who were approached, 21 (75%) participated in the study [median age: 43 years; 12 women (57%)]. Awareness and knowledge of gep testing were derived from several sources: international scientific meetings, participation in clinical studies, discussions with respected colleagues, and manufacturer-sponsored meetings. Oncologists observed that incorporating gep testing into their clinical practice resulted in several changes, including longer consultation times, second visits, and taking steps to minimize treatment delays. Oncologists expressed divergent opinions about the strength of evidence and added value of gep testing in guiding treatment decisions. CONCLUSIONS: Incorporation of gep testing into clinical practice in early-stage breast cancer required oncologists to make changes to their usual routines. The opinions of oncologists about the quality of evidence underpinning the test affected how much weight they gave to test results in treatment decision-making.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,012
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,031
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,080
Score d'incertitude au seuil0,158

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0120,031
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,001
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0010,001
Études des sciences et des technologies0,0070,006
Communication savante0,0040,002
Science ouverte0,0010,004
Intégrité de la recherche0,0020,002
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,135
Tête enseignante GPT0,469
Écart entre enseignants0,334 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations1
Publié2017
Routes d'admission3
Résumé présentoui

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