When molecules and morphology work together: lines of evidence for the validity of Caridina buehleri Roux (Crustacea : Decapoda : Atyidae) and for C. gueryi Marquet, Keith & Kalfatak as its junior synonym
Notice bibliographique
Résumé
The taxonomy of the freshwater shrimps Caridina (Atyidae) is very complex and confused mostly because the morphological characters that have traditionally been used for species delimitation and identification are highly plastic. There is thus a need for an integrative approach to their taxonomy. In total, 42 specimens belonging to either Caridina buehleri Roux, 1934 or Caridina gueryi Marquet, Keith & Kalfatak, 2009 were examined. We combined here morphological data from 12 specimens from the whole distributional range of the species, including type specimens with 16S mtDNA analyses from seven freshly sampled specimens, to verify the specific status of Caridina buehleri from Papua New-Guinea, Central Sulawesi, Western Samoa and the Solomon Islands, and C. gueryi from Vanuatu. The comparison of 24 morphological characters showed that morphological variations of character traits between C. gueryi and C. buehleri are widely overlapping and that no morphological feature can effectively split specimens into two clear groups. Molecular characters corroborated these results, as specimens from both groups were only separated by a 2% p-distance, a genetic distance that is coherent with their potentially high dispersal abilities. We thus consider C. gueryi as a junior synonym of C. buehleri. Finally, C. buehleri is characterised mainly by a styliform and characteristically indented rostrum and a long stylocerite. Detailed re-descriptions of the type specimens of C. buehleri and C. gueryi are given, as well as their geographical and ecological distribution.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,002 | 0,006 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,001 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,001 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,003 | 0,003 |
| Études des sciences et des technologies | 0,001 | 0,005 |
| Communication savante | 0,003 | 0,005 |
| Science ouverte | 0,001 | 0,003 |
| Intégrité de la recherche | 0,002 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,002 | 0,001 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».