Development of Safe Drugs: The hERG Challenge
Pourquoi ce travail est dans la base
Une base qui oublie comment elle a trouvé un travail ne peut pas être vérifiée. Voici les voies qui ont admis celui-ci.
Notice bibliographique
Résumé
Drug-induced blockade of human ether-a-go-go-related gene (hERG) remains a major impediment in delivering safe drugs to the market. Several drugs have been withdrawn from the market due to their severe cardiotoxic side effects triggered by their off-target interactions with hERG. Thus, identifying the potential hERG blockers at early stages of lead discovery is fast evolving as a standard in drug design and development. A number of in silico structure-based models of hERG have been developed as a low-cost solution to evaluate drugs for hERG liability, and it is now agreed that the hERG blockers bind at the large central cavity of the channel. Nevertheless, there is no clear convergence on the appropriate drug binding modes against the channel. The proposed binding modes differ in their orientations and interpretations on the role of key residues in the channel. Such ambiguities in the modes of binding remain to be a significant challenge in achieving efficient computational predictive models and in saving many important already Food and Drug Administration approved drugs. In this review, we discuss the spectrum of reported binding modes for hERG blockers, the various in silico models developed for predicting a drug's affinity to hERG, and the known successful optimization strategies to avoid off-target interactions with hERG.
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Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,013 | 0,003 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,005 | 0,001 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,001 | 0,001 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,001 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,003 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,001 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle