MétaCan
Menu
Retour à la cohorte
Enregistrement W2611759197 · doi:10.1093/aje/kwx027

Tools for the Precision Medicine Era: How to Develop Highly Personalized Treatment Recommendations From Cohort and Registry Data Using Q-Learning

2017· article· en· W2611759197 sur OpenAlexafffund
Elizabeth F. Krakow, Michael Hemmer, Tao Wang, Brent R. Logan, Mukta Arora, Stephen R. Spellman, Daniel R. Couriel, Amin M. Alousi, Joseph Pidala, Michael Last, Silvy Lachance, Erica E. M. Moodie

Notice bibliographique

RevueAmerican Journal of Epidemiology · 2017
Typearticle
Langueen
DomaineMathematics
ThématiqueAdvanced Causal Inference Techniques
Établissements canadiensMcGill University
Organismes subventionnairesNational Institute of Allergy and Infectious DiseasesNational Cancer InstituteOffice of Naval ResearchNational Heart, Lung, and Blood InstituteDepartment of Internal Medicine, University of UtahJuno TherapeuticsSanofi GenzymeTakeda OncologyU.S. NavyKite PharmaJanssen Scientific AffairsHealth Resources and Services AdministrationOtsuka PharmaceuticalCenter for International Blood and Marrow Transplant ResearchAstellas PharmaSwedish Orphan BiovitrumU.S. Department of Health and Human ServicesMiltenyi BiotecNational Institutes of HealthSeattle GeneticsTelomere DiagnosticsPharmacyclicsbluebird bioAtara BiotherapeuticsMeso Scale DiagnosticsCerus CorporationNovartis Pharmaceuticals CanadaJazz PharmaceuticalsSunesisDepartment of Epidemiology, Biostatistics and Occupational Health, McGill UniversityMedacActinium PharmaceuticalsChimerixU.S. Department of DefenseMedical College of WisconsinMcGill UniversityKaryopharm TherapeuticsUniversity of MinnesotaFred Hutchinson Cancer Research CenterDivision of Intramural Research, National Institute of Allergy and Infectious DiseasesFaculty of Medicine, McGill UniversityCelgeneMerckSpectrum PharmaceuticalsPatient-Centered Outcomes Research InstituteIncytePfizerAngiocrine BioscienceAstellas Pharma USBristol-Myers SquibbBe The Match FoundationShireNovartis Pharmaceuticals CorporationAmgenGilead SciencesHistoGeneticsMedImmuneMoffitt Cancer CenterSanofiNational Marrow Donor Program
Mots-clésMedicineRandomized controlled trialPersonalized medicinePopulationPrecision medicineCohortClinical trialMedical physicsMachine learningComputer scienceBioinformaticsSurgeryInternal medicinePathology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Q-learning is a method of reinforcement learning that employs backwards stagewise estimation to identify sequences of actions that maximize some long-term reward. The method can be applied to sequential multiple-assignment randomized trials to develop personalized adaptive treatment strategies (ATSs)-longitudinal practice guidelines highly tailored to time-varying attributes of individual patients. Sometimes, the basis for choosing which ATSs to include in a sequential multiple-assignment randomized trial (or randomized controlled trial) may be inadequate. Nonrandomized data sources may inform the initial design of ATSs, which could later be prospectively validated. In this paper, we illustrate challenges involved in using nonrandomized data for this purpose with a case study from the Center for International Blood and Marrow Transplant Research registry (1995-2007) aimed at 1) determining whether the sequence of therapeutic classes used in graft-versus-host disease prophylaxis and in refractory graft-versus-host disease is associated with improved survival and 2) identifying donor and patient factors with which to guide individualized immunosuppressant selections over time. We discuss how to communicate the potential benefit derived from following an ATS at the population and subgroup levels and how to evaluate its robustness to modeling assumptions. This worked example may serve as a model for developing ATSs from registries and cohorts in oncology and other fields requiring sequential treatment decisions.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,004
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,116
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesMétarecherche
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Autre devis · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Méthodes · Signal consensuel: Méthodes
Score de désaccord entre enseignants0,920
Score d'incertitude au seuil0,891

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0040,116
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,001
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0010,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,474
Tête enseignante GPT0,524
Écart entre enseignants0,050 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Devis d'étudeAutre devis
Domainenon disponible
GenreMéthodes

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations42
Publié2017
Routes d'admission2
Résumé présentoui

Explorer davantage

Même revueAmerican Journal of EpidemiologyMême sujetAdvanced Causal Inference TechniquesTravaux en français237 207