Evaluating usefulness of ING1 expression in stroma as a prognostic biomarker in breast cancer.
Notice bibliographique
Résumé
e11543 Background: INhibitor of Growth (ING) proteins are type II tumor suppressors that are frequently down-regulated in diverse cancer types, including the neoplastic transformation of breast tissue. The ING1 gene encodes multiple isoforms that have been shown to affect apoptosis, senescence and cell cycle. Recently, we reported that low levels of ING1 protein are correlated with metastasis in breast cancer patients. In the present study, we have used immunohistochemistry and an automated quantitative analysis (AQUA) technique to quantify ING1 expression in the tumor and stromal components of breast cancer tissue. Methods: We used the Calgary Tamoxifen Cohort, which contains 816 breast cancer patients, for this study. Cytokine profiling was done using immortalized human mammary fibroblasts (HMF3s) infected with adenoviral ING1a or GFP. To determine the activity of matrix metalloproteases MMP-1 and MMP-2, gelatin and casein zymography were performed, respectively. Three-dimensional culture was performed using ING1a or GFP infected HMF3s and MCF7 cells. Results: Higher expression of ING1 in stroma was associated with worse prognosis in breast cancer cohort. The predictive value of stromal ING1 was found to be more significant than established biomarkers such as HER2 and ER. An increase in the levels of G-CSF, GM-CSF and MIP-1a was observed. However, a significant decrease was found in pro-inflammatory cytokines such as IL-6, IL-8, PDGFA, PDGFB, VEGF and GRO in HMF3s cells upon ING1a overexpression. ING1a overexpression increased the metalloproteases (MMPs) levels and decreased the levels of MMP inhibitors (TIMPs). ING1a overexpressing HMF3s cells induced disorganization of breast cancer cell derived organoids. Conclusions: Our study indicates the role of ING1a in breast cancer stroma and its role in epithelial transformation and suggests ING1 as a novel prognostic biomarker in breast cancer.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,001 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
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score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».