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Enregistrement W2612321966

Investigating cellular and molecular interactions between the hard clam (Mercenaria mercenaria) and its pathogen Quahog Parasite Unknown (QPX)

2016· article· en· W2612321966 sur OpenAlexaboutno aff
Rachel B. Hartman

Notice bibliographique

RevueAcademic Commons (Stony Brook University) · 2016
Typearticle
Langueen
DomaineArts and Humanities
ThématiqueHermeneutics and Narrative Identity
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésMercenariaParasite hostingBiologyPathogenEcologyMicrobiologyComputer scienceWorld Wide Web
DOInon disponible

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Quahogs, or hard clams (Mercenaria mercenaria) are an economically important species of clam. They are often used for human consumption, but can also be indicators of water quality because of the bioaccumulation of contaminants within filter feeders. They are found abundantly on the east coast of the United States and Canada, and actively aquacultured from Massachusetts to Florida. The hard clam is a robust species with few naturally-occurring diseases. The most well-known disease of the hard clam is Quahog Parasite Unknown (QPX), a unicellular parasite found on the east coast of North America from Virginia up into Canada, causing well-documented mortality events. Though the presence of QPX disease has been documented since the 1960s, little information is available on cellular and molecular interactions between the parasite and clams. This research project targets the interactions between the clam immune system and QPX cells. The clam immune response to QPX consists of an inflammatory response that often involves the encapsulation of the parasite by clam immune cells, or hemocytes. This research identified the clam plasma proteins involved in the initial immune response to QPX and evaluated the role of plasma proteins in initiating the encapsulation response. The effect of exposure of clams to QPX on encapsulation rate and on the expression of plasma proteins that bind parasite cells was also determined. Results allowed the identification of proteins that recognize and bind parasite cells, providing molecular targets for future investigations of factors involved in clam resistance to the disease, and ultimately for the selection of resistant clam stocks. | 52 pages

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Sans objet · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,967
Score d'incertitude au seuil0,806

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0010,001
Communication savante0,0000,001
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,040
Tête enseignante GPT0,237
Écart entre enseignants0,197 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeSans objet
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2016
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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