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Enregistrement W2612427157 · doi:10.1038/ng.3892

Large-scale association analysis identifies new lung cancer susceptibility loci and heterogeneity in genetic susceptibility across histological subtypes

2017· review· en· W2612427157 sur OpenAlexafffund
James McKay, Younghun Han, Xuchen Zong, Robert Carreras‐Torres, David C. Christiani, Neil E. Caporaso, Mattias Johansson, Xiangjun Xiao, Yafang Li, Jinyoung Byun, Alison M. Dunning, Karen A. Pooley, David C. Qian, Xuemei Ji, Geoffrey Liu, Maria Timofeeva, Stig E. Bojesen, Xifeng Wu, Loı̈c Le Marchand, Demetrius Albanes, Heike Bickeböller, Melinda C. Aldrich, William S. Bush, Adonina Tardón, Gad Rennert, M. Dawn Teare, John K. Field, Lambertus A. Kiemeney, Philip Lazarus, Aage Haugen, Stephen Lam, Matthew B. Schabath, Angeline S. Andrew, Hongbing Shen, Yun‐Chul Hong, Jian‐Min Yuan, Pier Alberto Bertazzi, Angela Cecilia Pesatori, Yuanqing Ye, Nancy Diao, Li Su, Ruyang Zhang, Yonathan Brhane, Natasha B. Leighl, Jakob Sidenius Johansen, Anders Mellemgaard, Walid Saliba, Christopher A. Haiman, Lynne R. Wilkens, Ana Fernández‐Somoano, Guillermo Fernández‐Tardón, Erik H.F.M. van der Heijden, Jin Hee Kim, Juncheng Dai, Zhibin Hu, Michael P.A. Davies, Michael W. Marcus, Hans Brunnström, Jonas Manjer, Olle Melander, David C. Muller, Kim Overvad, Antonia Trichopoulou, ­Rosario ­Tumino, Jennifer A. Doherty, Matt P Barnett, Chu Chen, Gary E. Goodman, Angela Cox, Fiona Taylor, Penella J. Woll, Irene Brüske, H‐Erich Wichmann, Judith Manz, Thomas R Muley, Angela Risch, Albert Rosenberger, Kjell Grankvist, Mikael Johansson, Frances A. Shepherd, Ming‐Sound Tsao, Susanne M. Arnold, Eric B. Haura, Ciprian Bolca, Ivana Holcátová, Vladimí­r Janout, Milica Kontić, Jolanta Lissowska, Anush Mukeria, Simona Ognjanovic, Tadeusz Orłowski, Ghislaine Scélo, Beata Świątkowska, Давид Заридзе, Per Bakke, Vidar Skaug, Shanbeh Zienolddiny, Eric J. Duell, Lesley M. Butler, Woon‐Puay Koh, Yu‐Tang Gao, Richard S. Houlston, Victoria L. Stevens, Philippe Joubert, Maxime Lamontagne, David C. Nickle, Ma’en Obeidat, Wim Timens, Bin Zhu, Lei Song, Linda Kachuri, María Soler Artigas, Martin D. Tobin, Louise V. Wain, Þórunn Rafnar, Thorgeir E. Thorgeirsson, Gunnar W. Reginsson, Kāri Stefánsson, Dana B. Hancock, Laura J. Bierut, Margaret R. Spitz, Nathan Gaddis, Sharon M. Lutz, Fangyi Gu, Eric O. Johnson, Ahsan Kamal, Claudio W. Pikielny, Dakai Zhu, Sara Lindströem, Xia Jiang, Rachel F. Tyndale, Georgia Chenevix‐Trench, Jonathan Beesley, Yohan Bossé, Stephen J. Chanock, Paul Brennan, Maria Teresa Landi, Christopher I. Amos

Notice bibliographique

RevueNature Genetics · 2017
Typereview
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueGenetic Associations and Epidemiology
Établissements canadiensUniversité LavalSt. Paul's HospitalCentre for Addiction and Mental HealthInstitut universitaire de cardiologie et de pneumologie de QuébecUniversity of British ColumbiaPublic Health OntarioUniversity of TorontoUniversity Health NetworkSinai Health SystemLunenfeld-Tanenbaum Research InstitutePrincess Margaret Cancer CentreBC Cancer Agency
Organismes subventionnairesNational Cancer InstituteMedical Research CouncilUniversité LavalFonds de Recherche du Québec - SantéCanadian Institutes of Health ResearchNovo Nordisk FondenCancer Research UKWellcome TrustCancer Care OntarioInstitut universitaire de cardiologie et de pneumologie de Québec, Université LavalNational Institute on Drug AbuseDartmouth CollegeWorld Health Organization
Mots-clésBiologyLung cancerGeneticsLung cancer susceptibilityGenome-wide association studyGenetic associationComputational biologySingle-nucleotide polymorphismGenotypeGenePathology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex
Aucun résumé dans les sources couvertes. Son absence est consignée, pas traitée comme un négatif.

Aucun résumé. Ce n'est pas une lacune de cette base de données : OpenAlex n'en a pas non plus. 23,3 % de la base est dans cet état, et le tri y repère MOITIÉ moins de métarecherche ; l'absence est donc un biais mesuré, et non un champ manquant.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,002
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,003
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Synthèse · Signal consensuel: Synthèse
Score de désaccord entre enseignants0,003
Score d'incertitude au seuil0,013

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0020,003
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0020,001
Bibliométrie0,0020,002
Études des sciences et des technologies0,0000,001
Communication savante0,0010,001
Science ouverte0,0020,001
Intégrité de la recherche0,0020,002
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0030,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,029
Tête enseignante GPT0,385
Écart entre enseignants0,356 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreSynthèse

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations794
Publié2017
Routes d'admission2
Résumé présentnon

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