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Enregistrement W2612622977 · doi:10.1139/cjfr-2017-0007

Simple inheritance of a complex trait: figured wood in curly birch is caused by one semi-dominant and lethal Mendelian factor?

2017· article· en· W2612622977 sur OpenAlexvenueno aff
Katri Kärkkäinen, Anneli Viherä‐Aarnio, Pekka Vakkari, Risto Hagqvist, Kaisa Nieminen

Notice bibliographique

RevueCanadian Journal of Forest Research · 2017
Typearticle
Langueen
DomaineEnvironmental Science
ThématiqueForest ecology and management
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésMendelian inheritanceBiologyPhenotypeGeneticsAlleleLocus (genetics)Betula pendulaInheritance (genetic algorithm)TraitGeneBotany

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Even though individuals with a deviant morphology have been elemental in genetics of model species, they have thus far been largely ignored in the studies of forest trees. Here we studied the inheritance of curly-grained and brown-figured wood phenotype in curly birch (Betula pendula var. carelica (Mercklin) Hämet-Ahti). In addition of the figured wood, curly birches display reduced and aberrant growth, indicating that the causative locus (loci) is (are) vital for normal tree development. To explore the genetic basis of this mutation, we studied the inheritance of the curly birch phenotype in a progeny trial (crosses between curly birch parent trees, between curly and normal phenotypes, and from selfings of curly trees). Based on the external morphology, the phenotypes of 11-year-old progeny trees were scored as either curly or wild. Based on the phenotypic segregation ratios, we postulate a simple Mendelian inheritance model for curliness: (i) a one-locus, two-allele model in which the allele coding for curly phenotype is dominant over the allele coding for normal phenotype and (ii) the semi-dominant curly allele is lethal when homozygous. We expect that further studies on the molecular genetic basis of the curly birch phenotype will provide valuable information on the developmental pathways involved in wood formation.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,002
Score d'incertitude au seuil0,007

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0010,000
Études des sciences et des technologies0,0000,001
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,073
Tête enseignante GPT0,324
Écart entre enseignants0,251 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations11
Publié2017
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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