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Enregistrement W2612923159 · doi:10.1111/nan.12410

Diagnostic anoctamin‐5 protein defect in patients with ANO5‐mutated muscular dystrophy

2017· article· en· W2612923159 sur OpenAlexaff
Anna Vihola, H. Luque, Marco Savarese, S. Penttilä, Mikaela Lindfors, France Leturcq, B. Eymard, Giorgio Tasca, Bernard Brais, Talita C. Conte, Karine Charton, Bjarne Udd

Notice bibliographique

RevueNeuropathology and Applied Neurobiology · 2017
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueMuscle Physiology and Disorders
Établissements canadiensMcGill UniversityMontreal Neurological Institute and Hospital
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésMuscular dystrophyImmunohistochemistryDysferlinAntibodySkeletal muscleMutationPoint mutationMolecular biologyBiologyDuchenne muscular dystrophyMonoclonal antibodyPathologyGeneGeneticsMedicineEndocrinology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

AIMS: Previously, detection of ANO5 protein has been complicated by unspecific antibodies, most of which have not identified the correct protein. The aims of the study were to specify ANO5 protein expression in human skeletal muscle, and to investigate if the ANO5 protein levels are affected by different ANO5 mutations in anoctaminopathy patients. METHODS: Four different antibodies were tested for ANO5 specificity. A sample preparation method compatible with membrane proteins, combined with tissue fractionation was used to determine ANO5 expression in cell cultures expressing ANO5, in normal muscles and eight patient biopsies with six different ANO5 mutations in homozygous or compound heterozygous states, and in other dystrophies. RESULTS: Only one specific monoclonal N-terminal ANO5 antibody was efficient in detecting the protein, showing that ANO5 is expressed as a single 107 kD polypeptide in human skeletal muscle. The truncating mutations c.191dupA and c.1261C>T were found to abolish ANO5 expression, whereas the studied point mutations had variable effects; however, all the ANO5 mutations resulted in clearly reduced ANO5 expression in the patient muscle membrane fraction. Attempts to detect ANO5 using immunohistochemistry were not yet successful. CONCLUSIONS: The data presented here indicate that the ANO5 protein expression is decreased in ANO5-mutated muscular dystrophy and that most of the non-truncating pathogenic ANO5 mutations likely destabilize the protein and cause its degradation. The method described here allows direct analysis of human ANO5 protein, which can be used in diagnostics, for evaluating the pathogenicity of the potentially harmful ANO5 variants of uncertain significance.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesMéta-épidémiologie (sens strict)
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,550
Score d'incertitude au seuil1,000

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,001
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,003
Tête enseignante GPT0,184
Écart entre enseignants0,181 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations23
Publié2017
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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