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Enregistrement W2612942185 · doi:10.1101/136598

FplA From <i>Fusobacterium nucleatum</i> is a Type Vd autotransporter phospholipase with a proposed role in altered host signaling and evasion of autophagy

2017· preprint· en· W2612942185 sur OpenAlexaff
Michael A. Casasanta, Christopher C. Yoo, Hans B. Smith, A. J. Duncan, Kyla Cochrane, A. Cameron Varano, Emma Allen‐Vercoe, Daniel J. Slade

Notice bibliographique

RevuebioRxiv (Cold Spring Harbor Laboratory) · 2017
Typepreprint
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueClostridium difficile and Clostridium perfringens research
Établissements canadiensUniversity of GuelphSimon Fraser UniversityBC Cancer Agency
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésFusobacterium nucleatumBiologyMicrobiologyVirulenceSecretionBacterial outer membranePhospholipaseVirulence factorCell biologyBiochemistryGeneBacteriaPorphyromonas gingivalisEnzymeGeneticsEscherichia coli

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

ABSTRACT Fusobacterium nucleatum is a pathogenic oral bacterium that is linked to multiple human infections and colorectal cancer. While most Gram-negative pathogens utilize secretion systems for cellular invasion and infection, F. nucleatum lacks Type I, II, III, IV, and VI secretion. By contrast, F. nucleatum strains are enriched in Type V secreted autotransporters, which are Gram-negative bacterial virulence factors critical for binding and entry into host cells. Here we present the first biochemical characterization of a F. nucleatum Type Vd phospholipase class A1 autotransporter (strain ATCC 25586, gene FN1704) that we hereby rename Fusobacterium phospholipase autotransporter (FplA). FplA is expressed as a full-length 85 kDa outer membrane embedded protein, or as a truncated phospholipase domain that remains associated with the outer membrane. Using multiple FplA constructs we characterized lipid substrate specificity, potent inhibitors, and chemical probes to detect and track this enzyme family. While the role of FplA is undetermined in F. nucleatum virulence, homologous phospholipases from intracellular pathogens are critical for vacuole escape, altered host signaling, and intracellular survival. We hypothesize that upon intracellular invasion of the host, FplA could play a role in phagosomal escape, subversion of autophagy, or eicosanoid-mediated inflammatory signaling, as we show that FplA binds with high affinity to host phosphoinositide signaling lipids critical to these processes. Our identification of substrates, inhibitors, and chemical probes for FplA, in combination with an fplA gene deletion strain, encompass a powerful set of tools for the future analysis of FplA in vivo . In addition, these studies will guide the biochemical characterization of additional Type Vd autotransporter phospholipases. IMPORTANCE F. nucleatum is an emerging pathogen that is linked to the pathogenesis of colorectal cancer, yet there is a critical knowledge gap in the mechanisms used by this bacterium to elicit changes in the host for intracellular entry and survival. As phospholipases are critical virulence factors for intracellular bacteria to initiate vacuole lysis, cell-to-cell spread, and evasion of autophagy, we set out to characterize a unique Type Vd secreted phospholipase A1 enzyme from F. nucleatum . Our results show a potential role for modulating host signaling pathways through cleavage of phosphoinositide dependent signaling lipids. These studies open the door for further characterization of this unique enzyme family in bacterial virulence, host-pathogen interactions, and for F. nucleatum , in colorectal carcinogenesis.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,003

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,017
Tête enseignante GPT0,244
Écart entre enseignants0,227 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations1
Publié2017
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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