SCAR Marker for the A Genome of Bananas (Musa spp. L.) Supports Lack of Differentiation between the A and B Genomes
Notice bibliographique
Résumé
Bananas (Musa spp. L.) are grouped on the basis of their genomic origins in relation to Musa acuminata (A genome) and M. balbisiana (B genome). The two ancestral wild seeded diploid species evolved in vastly different geographical areas and contributed several agronomic traits towards the present genetic composition of cultivated bananas. Most cultivated bananas are triploid (AAA, AAB and ABB), some are diploid (AA, BB and AB) and a few are tetraploids (AAAA, AAAB, AABB and ABBB). Limitations on the correct identification of the A and B genomes in Musa have generated need for the development of new and more reliable techniques. Distinguishing the A and the B genome remains practically and theoretically important for banana breeders. The aim of the research was to develop a DNA based A genome specific marker for the identification of the A genome in bananas. A putative marker (600 bp) specific to the A genome was identified by Random Amplified Polymorphic DNA (RAPD) technique. A sequence characterised amplified region (SCAR) marker was developed from the RAPD amplicon. The SCAR primers annealed a 500 bp fragment specific to the A genome in a sample of 22 randomly selected homo- and heterogenomic A genome containing accessions representing different genome combinations. The 500 bp SCAR marker is useful for the identification of the A genome. However an additional 700 bp fragment annealed in all M. balbisiana genotypes and in five of the eight heterogenomic accessions, suggesting lack of differentiation between the A and B genome. This study has provided a 500 bp A genome SCAR marker and recent evidence that the A and B genomes of banana may not be as differentiated as previously considered.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,001 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,001 | 0,001 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,001 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».