Antibacterial mechanism of high-mobility group nucleosomal-binding domain 2 on the Gram-negative bacteria Escherichia coli
Notice bibliographique
Résumé
OBJECTIVE: To investigate the antibacterial mechanism of high-mobility group nucleosomal-binding domain 2 (HMGN2) on Escherichia coli K12, focusing on the antibacterial and antibiofilm formation effects. Its chemotactic activity on human neutrophils was also investigated. METHODS: Human tissue-derived HMGN2 (tHMGN2) was extracted from fresh uterus fiber cystadenoma and purified by HP1100 reversed-phase high-performance liquid chromatography (RP-HPLC). Recombinant human HMGN2 (rHMGN2) was generated in E. coli DE3 carrying PET-32a-c(+)-HMGN2. Antibacterial activity of HMGN2 was determined using an agarose diffusion assay and minimum inhibitory concentration (MIC) of HMGN2 was determined by the microdilution broth method. Bacterial membrane permeability assay and DNA binding assay were performed. The antibiofilm effect of HMGN2 was investigated using a crystal violet assay and electron microscopy scanning. The activating effect and chemotactic activity of HMGN2 on neutrophils were determined using a nitroblue tetrazolium (NBT) reduction assay and Transwell chamber cell migration assay, respectively. RESULTS: HMGN2 showed a relatively high potency against Gram-negative bacteria E. coli and the MIC of HMGN2 was 16.25 μg/ml. Elevated bacterial membrane permeability was observed in HMGN2-treated E. coli K12. HMGN2 could also bind the bacterial plasmid and genomic DNA in a dose-dependent manner. The antibiofilm effect of HMGN2 on E. coli K12 was confirmed by crystal violet staining and scanning electron microscopy. However, the activating effects and chemotactic effects of HMGN2 on human neutrophils were not observed. CONCLUSIONS: As an antimicrobial peptide (AMP), HMGN2 possessed a good capacity for antibacterial and antibiofilm activities on E. coli K12. This capacity might be associated with disruption of the bacterial membrane and combination of DNA, which might affect the growth and viability of E. coli.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».