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Enregistrement W2613927077 · doi:10.14288/1.0343427

Induction of wild-type SOD1 misfolding, aggregation and its cell-to-cell propagation

2019· article· en· W2613927077 sur OpenAlexaff
Edward Pokrishevsky

Notice bibliographique

RevuecIRcle (University of British Columbia) · 2019
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueCancer, Hypoxia, and Metabolism
Établissements canadiensUniversity of British Columbia
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésCellCell biologyChemistryBiologyGenetics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Amyotrophic Lateral Sclerosis (ALS) is a fatal neurodegenerative disease characterized by progressive degeneration and loss of motor neurons that appears to spread through the neuroaxis in a spatiotemporally restricted manner. Misfolded Cu/Zn superoxide dismutase (SOD1) has been detected in all ALS patients, despite SOD1 mutations accounting for only 2% of total cases, while the presence of inclusions containing pathological TAR-DNA binding protein-43 (TDP-43) represent a hallmark of all non-SOD1/FUS familial ALS. We previously reported that TDP-43 and FUS can trigger misfolding of human wild-type SOD1 (HuWtSOD1) in living cells, however the mechanisms and consequences are unknown. Here, we used immunocytochemistry, immunoprecipitation and cell viability studies to demonstrate that TDP-43 or FUS-induced misfolded HuWtSOD1 can propagate from cell-to-cell via conditioned media, and seed cytotoxic misfolding of endogenous HuWtSOD1 in the recipient cells in a prion-like fashion. Knockdown of SOD1 using siRNA in recipient cells, or incubation of conditioned media with misfolded SOD1-specific antibodies, inhibits intercellular transmission, indicating that HuWtSOD1 is an obligate seed and substrate of propagated misfolding. Furthermore, we developed several chimeric SOD1-GFP proteins that we validated to aggregate in the presence of pathological SOD1 or TDP-43 seed. We used this assay, along with immunofluorescence, live-cell microscopy and flow cytometry studies, to show that intermolecular conversion of SOD1 by pathological TDP-43 is mediated by tryptophan residues in both proteins. Furthermore, we used the reporter proteins to show that human spinal cord extracts prepared from familial, but not sporadic, ALS patients can trigger SOD1 aggregation in cultured cells. Finally, we used this system to show that small molecules, akin to 5-fluorouridine, can block this intermolecular kindling of SOD1 aggregation, and demonstrated that our assay can be used as a high-throughput tool for screening drugs against induced SOD1 aggregation. Altogether, our studies indicate that pathological TDP-43 and FUS may exert motor neuron pathology in ALS through the initiation of tryptophan-dependent propagated SOD1 misfolding. Furthermore, it is key to recognize that elucidation of the pathogenic role of a simple structural motif in ALS may provide a framework for understanding other neurodegenerative diseases in which propagated protein misfolding is shown to occur.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,002

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,005
Tête enseignante GPT0,173
Écart entre enseignants0,167 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2019
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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