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Enregistrement W2614173025 · doi:10.1371/journal.pgen.1006790

Specification and spatial arrangement of cells in the germline stem cell niche of the Drosophila ovary depend on the Maf transcription factor Traffic jam

2017· article· en· W2614173025 sur OpenAlexafffund
Trupti Panchal, Xi Chen, Ekaterina Alchits, Rachel Youjin Oh, James Poon, Jane Kouptsova, Frank A. Laski, Dorothea Godt

Notice bibliographique

RevuePLoS Genetics · 2017
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueDevelopmental Biology and Gene Regulation
Établissements canadiensUniversity of Toronto
Organismes subventionnairesNatural Sciences and Engineering Research Council of CanadaCanada First Research Excellence FundUniversity of TorontoExelixis
Mots-clésBiologyCell biologyGermlineStem cellNicheTranscription factorSomatic cellGeneticsGeneEcology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Germline stem cells in the Drosophila ovary are maintained by a somatic niche. The niche is structurally and functionally complex and contains four cell types, the escort, cap, and terminal filament cells and the newly identified transition cell. We find that the large Maf transcription factor Traffic jam (Tj) is essential for determining niche cell fates and architecture, enabling each niche in the ovary to support a normal complement of 2-3 germline stem cells. In particular, we focused on the question of how cap cells form. Cap cells express Tj and are considered the key component of a mature germline stem cell niche. We conclude that Tj controls the specification of cap cells, as the complete loss of Tj function caused the development of additional terminal filament cells at the expense of cap cells, and terminal filament cells developed cap cell characteristics when induced to express Tj. Further, we propose that Tj controls the morphogenetic behavior of cap cells as they adopted the shape and spatial organization of terminal filament cells but otherwise appeared to retain their fate when Tj expression was only partially reduced. Our data indicate that Tj contributes to the establishment of germline stem cells by promoting the cap cell fate, and controls the stem cell-carrying capacity of the niche by regulating niche architecture. Analysis of the interactions between Tj and the Notch (N) pathway indicates that Tj and N have distinct functions in the cap cell specification program. We propose that formation of cap cells depends on the combined activities of Tj and the N pathway, with Tj promoting the cap cell fate by blocking the terminal filament cell fate, and N supporting cap cells by preventing the escort cell fate and/or controlling the number of cap cell precursors.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,143
Score d'incertitude au seuil0,218

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,028
Tête enseignante GPT0,227
Écart entre enseignants0,199 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations50
Publié2017
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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