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Enregistrement W2616221470 · doi:10.1101/139691

<i>Zfp423</i> , a Joubert syndrome gene, is a domain-specific regulator of cell cycle progression, DNA damage response and Purkinje cell development in the cerebellar primordium

2017· preprint· en· W2616221470 sur OpenAlexafffund
Filippo Casonil, Laura Crocil, Camilla Bosonel, Roberta D’Ambrosio, Aurora Badaloni, Davide Gaudesi, Valeria Barilil, Justyna R. Sarna, Lino Tessarollo, Ottavio Cremona, Richard Hawkes, Søren Warming, G. Giacomo Consalez

Notice bibliographique

RevuebioRxiv (Cold Spring Harbor Laboratory) · 2017
Typepreprint
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueGenetic and Kidney Cyst Diseases
Établissements canadiensUniversity of Calgary
Organismes subventionnairesNational Cancer InstituteCanadian Institutes of Health ResearchNational Institutes of HealthMinistero della Salute
Mots-clésNeurogenesisBiologyOLIG2Cell biologyAsymmetric cell divisionPurkinje cellCerebellumCerebellar hypoplasia (non-human)Progenitor cellZinc finger transcription factorNeural stem cellNeural developmentCell fate determinationNeuroscienceGeneticsZinc fingerTranscription factorCell divisionGeneStem cellCentral nervous systemOligodendrocyteCell

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

ABSTRACT Neurogenesis is a tightly regulated process whose success depends on the ability to balance the expansion/maintenance of an undifferentiated neural progenitor pool with the precisely timed birth of sequential generations of neurons. The Zfp423 gene encodes a 30-Zn-finger transcription factor (TF) that acts as a scaffold in the assembly of complex transcriptional and cellular machineries regulating neural development. While null mutants for Zfp423 feature a severe cerebellar hypoplasia, the underlying mechanism is only partially characterized. Mutations of the human ortholog ZNF423 have been identified in patients carrying cerebellar vermis hypoplasia (CVH) or Joubert Syndrome (JS), associated with other signs of classical ciliopathy outside the central nervous system (CNS). ZNF423 also plays a role in the DNA damage response (DDR). To further characterize the role of ZFP423 in cerebellar neurogenesis, with a focus on Purkinje cells (PC) development, we analyzed two previously undescribed mutant mouse lines carrying allelic in-frame deletions of the corresponding gene, selectively affecting two functionally characterized protein-protein interaction domains, affecting zinc (Zn) fingers 9-20 or 28-30. Some phenotypic defects are allele specific: Zfp423 Δ9-20/Δ9-20 mutants exhibit a depletion of the OLIG2+ PC progenitor pool in the cerebellar ventricular zone (VZ). In these mutants, M-phase progenitors display changes in spindle orientation indicative of a precocious switch from symmetric to asymmetric cell division. Conversely, the Zfp423 Δ28-30/Δ28-30 primordium displays a sharp decrease in the expression of PC differentiation markers, including CORL2, despite an abundance of cycling PC progenitors. Moreover, and importantly, in both mutants VZ progenitor cell cycle progression is remarkably affected, and factors involved in the DDR are substantially upregulated in the VZ and in postmitotic precursors alike. Our in vivo evidence sheds light on the domain-specific roles played by ZFP423 in different aspects of PC progenitor development, and at the same time supports the emerging notion that an impaired DNA damage response may be a key factor in the pathogenesis of JS and other ciliopathies.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,003

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,007
Tête enseignante GPT0,211
Écart entre enseignants0,204 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations1
Publié2017
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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