MétaCan
Menu
Retour à la cohorte
Enregistrement W2616791438 · doi:10.14288/1.0343276

Insights into leukemogenesis in a MN1-induced leukemia model

2017· article· en· W2616791438 sur OpenAlexaff
Courteney K. Lai

Notice bibliographique

RevuecIRcle (University of British Columbia) · 2017
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueNeuroblastoma Research and Treatments
Établissements canadiensUniversity of British Columbia
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésLeukemiaComputer scienceMedicineImmunology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Acute myeloid leukemia (AML) spans a wide array of distinct clinical entities and likely molecular determinants. Despite early treatment success, many aspects of leukemogenesis remain poorly understood, including determinants of leukemic phenotype and identity, and genes and pathways critical to leukemic stem cell (LSC) function. Meningioma 1 (MN1) is a transcriptional co-factor that is an independent prognostic marker for normal karyotype AML, with high expression linked to poor survival and resistance to treatment by ATRA-induced differentiation. MN1 is also a potent and sufficient oncogene in murine leukemia, able to block differentiation and promote LSC self-renewal through transformation of cells at the common myeloid progenitor level. Using this single-hit oncogenic model, MN1 overexpression was exploited to gain further insight into the leukemic process. The objective of this thesis work was to identify and better understand key regulators in LSC function. Sixteen MN1 structural variants were generated to investigate if the leukemic properties of increased proliferation and self-renewal, arrested hematopoietic differentiation, in vivo leukemogenic activity, and resistance to all-trans retinoic acid-induced differentiation could be localised to specific protein regions. Functional assays revealed that the MN1 C-terminus is critical for blocking myeloid and lymphoid differentiation and ATRA resistance while the N-terminus is essential for leukemogenicity, proliferation and self-renewal, and arrested erythro-megakaryocyte differentiation, demonstrating that these leukemic properties can be attributed to specific and largely distinct regions. To identify key genes and pathways underlying leukemic activity, the phenotypic heterogeneity of MN1 leukemic cells was functionally assessed, revealing leukemic and non-leukemic subsets. Gene expression profiling of these subsets was combined with previously-published datasets comparing wildtype leukemic MN1 and mutant versions with varying leukemogenic activity to identify candidate genes critical to leukemia. Through functional analysis of leukemic properties, Hlf and HoxA9 were identified as critical to in vitro proliferation, self-renewal, and impaired myeloid differentiation in MN1 leukemia. Furthermore, this work identifies Meis2 as a novel player in MN1-induced leukemia, with essential roles in proliferation, self-renewal, differentiation, and apoptosis. Together, these models provide a platform to unravel the basis for dysregulated gene expression associated with leukemia and to probe the cellular and molecular determinants of leukemogenesis.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,004

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,021
Tête enseignante GPT0,233
Écart entre enseignants0,212 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2017
Routes d'admission1
Résumé présentoui

Explorer davantage

Même revuecIRcle (University of British Columbia)Même sujetNeuroblastoma Research and TreatmentsTravaux en français237 207