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Enregistrement W2617341365 · doi:10.1038/ncomms15497

MicroRNAs 146a/b-5 and 425-3p and 24-3p are markers of antidepressant response and regulate MAPK/Wnt-system genes

2017· article· en· W2617341365 sur OpenAlexafffund
Juan Pablo López, Laura M. Fiori, Cristiana Cruceanu, Rixing Lin, Benoît Labonté, Hannah M. Cates, Elizabeth A. Heller, Vincent Vialou, Stacy M. Ku, Christophe Gerald, Ming-Hu Han, Jane A. Foster, Benício N. Frey, Claudio N. Soares, Daniel J. Müller, Faranak Farzan, Francesco Leri, Glenda MacQueen, Harriet Feilotter, Kathrin Tyryshkin, Kenneth Evans, Peter Giacobbe, Pierre Blier, Raymond W. Lam, Roumen Milev, Sagar V. Parikh, Susan Rotzinger, Stephen C. Strother, Cathryn M. Lewis, Katherine J. Aitchison, Gayle Wittenberg, Naguib Mechawar, Eric J. Nestler, Rudolf Uher, Sidney H. Kennedy, Gustavo Turecki

Notice bibliographique

RevueNature Communications · 2017
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueMicroRNA in disease regulation
Établissements canadiensUniversity of AlbertaDalhousie UniversityBaycrest HospitalVancouver Coastal HealthUniversity of CalgaryUniversity of GuelphCentre for Addiction and Mental HealthSt. Michael's HospitalQueen's UniversityIndoc ResearchMcMaster UniversityUniversity of British ColumbiaSurrey Memorial HospitalRoyal Ottawa Mental Health CentreSt. Joseph’s Healthcare HamiltonUniversity of TorontoUniversity Health NetworkUniversity of OttawaMcGill UniversityDouglas Mental Health University Institute
Organismes subventionnairesFonds de Recherche du Québec - SantéCanadian Institutes of Health ResearchGovernment of AlbertaEuropean CommissionNational Institute on Drug AbuseGovernment of OntarioNational Institutes of HealthNational Institute of Mental HealthOntario Brain Institute
Mots-clésWnt signaling pathwaymicroRNAMajor depressive disorderAntidepressantDepression (economics)GeneMAPK/ERK pathwayBiologyPlaceboBioinformaticsMedicineInternal medicineOncologyGeneticsSignal transductionHippocampusPathology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Antidepressants (ADs) are the most common treatment for major depressive disorder (MDD). However, only ∼30% of patients experience adequate response after a single AD trial, and this variability remains poorly understood. Here, we investigated microRNAs (miRNAs) as biomarkers of AD response using small RNA-sequencing in paired samples from MDD patients enrolled in a large, randomized placebo-controlled trial of duloxetine collected before and 8 weeks after treatment. Our results revealed differential expression of miR-146a-5p, miR-146b-5p, miR-425-3p and miR-24-3p according to treatment response. These results were replicated in two independent clinical trials of MDD, a well-characterized animal model of depression, and post-mortem human brains. Furthermore, using a combination of bioinformatics, mRNA studies and functional in vitro experiments, we showed significant dysregulation of genes involved in MAPK/Wnt signalling pathways. Together, our results indicate that these miRNAs are consistent markers of treatment response and regulators of the MAPK/Wnt systems.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,865
Score d'incertitude au seuil0,588

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,001
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,013
Tête enseignante GPT0,278
Écart entre enseignants0,265 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations206
Publié2017
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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