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Enregistrement W2617573219

Synthesis and Biological Evaluation of Antibacterial Small Molecule Activators of Caseinolytic Protease P and the Synthetic Utility of Metal Carboxylate Salts in Amidation Reactions with Amines

2016· dissertation· en· W2617573219 sur OpenAlexaboutno aff
Jordan D. Goodreid

Notice bibliographique

RevueTSpace (University of Toronto) · 2016
Typedissertation
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueEnzyme Production and Characterization
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésCarboxylateChemistryCombinatorial chemistryProteaseSmall moleculeOrganic chemistryBiochemistryEnzyme
DOInon disponible

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

This thesis is presented in two parts and summarizes work carried out in the laboratory of Professor Robert A. Batey at the University of Toronto from September 2009 through March 2016. Part 1 of this thesis covers the synthesis and biological evaluation of two types of small molecules which target bacterial Caseinolytic Protease P (ClpP); these are the cyclic acyldepsipeptide (ADEP) class of antibiotics and related analogues (Chapter 2) and the ACP1 analogues (Chapter 3). Part 2 of this thesis outlines work related to the synthetic utility of metal carboxylate salts in amide bond-forming reactions with amines.\nPart 1 of this thesis begins with an introductory chapter (Chapter 1) on antibiotics to familiarize the reader with antibiotic classes, bacterial mechanisms of drug resistance as well as strategies for antibacterial drug discovery. Next, Chapter 2 details the total synthesis and biological evaluation of the A54556 ADEP natural products and related analogues. In the course of our investigations on this class of compound, a rapid two-step synthetic approach was developed that utilized a combination of solid-phase peptide chemistry and a novel lanthanide salt-promoted macrolactonization reaction. Importantly, this methodology was used to prepare several structurally diverse analogues. Chapter 3 then describes the synthesis and biological evaluation of ACP1 and related analogues. In contrast to the ADEPs, ACP1 was discovered using a high-throughput screen and several structurally unique analogues were synthesized in an attempt to improve potency and understand the structural features that impart biological activity. \nPart 2 of this thesis covers amidation reactions from the direct coupling of metal carboxylate salts with amines or ammonium salts in the presence of the coupling reagent HBTU (Chapter 4). A wide variety of carboxylate salts were examined and the methodology was later extended to multistep, one-pot variants using carboxylate salts that were generated in situ.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,317
Score d'incertitude au seuil1,000

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,017
Tête enseignante GPT0,240
Écart entre enseignants0,223 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations1
Publié2016
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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