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Enregistrement W2617609684 · doi:10.1093/neuonc/nox083.178

MEDU-28. INVESTIGATING THE ROLE OF THE RNA BINDING PROTEIN, MUSASHI, IN GROUP 3 MEDULLOBLASTOMA

2017· article· en· W2617609684 sur OpenAlexaff
Michelle Kameda-Smith, Chitra Venugopal

Notice bibliographique

RevueNeuro-Oncology · 2017
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueRNA Research and Splicing
Établissements canadiensMcMaster University
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésNeural stem cellGene knockdownBiologyMedulloblastomaCarcinogenesisCancer researchStem cellProgenitor cellRNA-binding proteinCell fate determinationCancer stem cellGliomaTranscriptional regulationCellRNACancerGeneGene expressionCell biologyGeneticsTranscription factor

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Pediatric brain tumours are the leading cause of solid cancer mortality with medulloblastoma (MB) representing the most frequent malignant solid central nervous system (CNS) tumour. To date, most experimental efforts to understand the biological mechanism of solid cancers have been directed towards transcriptional regulatory mechanisms that modulate fate determination in stem and progenitor cells. However, little is known regarding post-transcriptional pathways that contribute to mRNA stability, translation into protein, and functional effects on cell fate. The mRNA binding protein, Musashi (Msi) has been observed to play a crucial role in promoting stem cell self–renewal and is implicated in CNS tumours including glioma and MB with associated poor clinical prognosis. Since the initial description of the “medulloblast” as the putative MB cell of origin, a crucial association between neural stem cells and MB tumorigenesis has long been postulated. Contemporary experimental frameworks recognize this paradigm as the cancer stem cell hypothesis. Since increasing brain tumour stem cell or brain tumour-initiating cell (BTIC) frequency is associated with tumor aggressiveness and poor patient outcome, we probed for Msi1 within 251 primary human MBs from four transcriptional databases and 74 NanoString-subgrouped MBs, and found it was enriched in aggressive MB subgroups. Applying gene knockdown and overexpression of Msi1 and 2 in Group 3 MB, we have performed in vitro assays elucidating how these RNA-binding proteins help to maintain the BTIC state. In parallel, cross-linking and immunoprecipitation experimentation have shed some light on the mechanism of Msi’s influence on RNA fate. Though transcriptional manipulation has uncovered novel druggable targets to treat MB, bench-to-bedside clinical translation of these targets has yet to yield significant patient benefit. For the first time, Msi analysis in MB provides a novel paradigm for treatment of MB through targeting post-transcriptional pathways and regulators.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,002
Score d'incertitude au seuil0,005

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,017
Tête enseignante GPT0,288
Écart entre enseignants0,271 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2017
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