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Enregistrement W2617673757 · doi:10.1101/100164

Network component analysis reveals developmental trajectories of structural connectivity and specific alterations in autism spectrum disorder

2017· preprint· en· W2617673757 sur OpenAlexaff
Gareth Ball, Richard Beare, Marc L. Seal

Notice bibliographique

RevuebioRxiv (Cold Spring Harbor Laboratory) · 2017
Typepreprint
Langueen
DomaineNeuroscience
ThématiqueFunctional Brain Connectivity Studies
Établissements canadiensRoyal Ottawa Mental Health Centre
Organismes subventionnairesState Government of VictoriaUniversity of MelbourneRoyal Children's Hospital FoundationChildren's Hospital Foundation
Mots-clésAutism spectrum disorderNeuroscienceAutismNon-negative matrix factorizationSubnetworkSet (abstract data type)PsychologyComputer scienceMatrix decompositionDevelopmental psychologyComputer networkPhysics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

The structural organisation of the brain can be characterised as a hierarchical ensemble of segregated modules linked by densely interconnected hub regions that facilitate distributed functional interactions. Disturbances to this network may be an important marker of abnormal development. Recently, several neurodevelopmental disorders, including autism spectrum disorder (ASD), have been framed as disorders of connectivity but the full nature and timing of these disturbances remain unclear. In this study, we use non-negative matrix factorisation, a data-driven, multivariate approach, to model the structural network architecture of the brain as a set of superposed subnetworks, or network components. In an openly available dataset of 196 subjects scanned between 5 to 85 years we identify a set of robust and reliable subnetworks that develop in tandem with age and reflect both anatomically local and long-range, network hub connections. In a second experiment, we compare network components in a cohort of 51 high-functioning ASD adolescents to a group of age-matched controls. We identify a specific subnetwork representing an increase in local connection strength in the cingulate cortex in ASD (t=3.44, p<0.001). This work highlights possible long-term implications of alterations to the developmental trajectories of specific cortical subnetworks.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,003
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Simulation ou modélisation · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,006
Score d'incertitude au seuil0,012

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,003
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0010,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,028
Tête enseignante GPT0,241
Écart entre enseignants0,213 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeSimulation ou modélisation
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations1
Publié2017
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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