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Enregistrement W2618644706 · doi:10.1063/1.4984767

Characterization of microfluidic clamps for immobilizing and imaging of <i>Drosophila melanogaster</i> larva's central nervous system

2017· article· en· W2618644706 sur OpenAlexafffund
Reza Ghaemi, Pouya Rezai, Fatemeh Rafiei Nejad, P. Ravi Selvaganapathy

Notice bibliographique

RevueBiomicrofluidics · 2017
Typearticle
Langueen
DomaineNeuroscience
ThématiqueNeurobiology and Insect Physiology Research
Établissements canadiensYork UniversityMcMaster University
Organismes subventionnairesNatural Sciences and Engineering Research Council of CanadaNational Institutes of HealthOntario Ministry of Economic Development and Innovation
Mots-clésDrosophila melanogasterBiologyNeuroscienceCentral nervous systemModel organismCalcium imagingNervous systemSensory systemDrosophila (subgenus)MicroinjectionAnatomyCell biologyGeneChemistryGenetics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Drosophila melanogaster is a well-established model organism to understand biological processes and study human diseases at the molecular-genetic level. The central nervous system (CNS) of Drosophila larvae is widely used as a model to study neuron development and network formation. This has been achieved by using various genetic manipulation tools such as microinjection to knock down certain genes or over-express proteins for visualizing the cellular activities. However, visualization of an intact-live neuronal response in larva's Central Nervous System (CNS) is challenging due to robust digging/burrowing behaviour that impedes neuroimaging. To address this problem, dissection is used to isolate and immobilize the CNS from the rest of the body. In order to obtain a true physiological response from the Drosophila CNS, it is important to avoid dissection, while the larva should be kept immobilized. In this paper, a series of microfluidic clamps were investigated for intact immobilization of the larva. As a result, an optimized structure for rapid mechanical immobilization of Drosophila larvae for CNS imaging was determined. The clamping and immobilization processes were characterized by imaging and movement measurement of the CNS through the expression of genetically encoded Calcium sensor GCaMP5 in all sensory and cholinergic interneurons. The optimal structure that included two 3D constrictions inside a narrowed channel considerably reduced the internal CNS capsule movements. It restricts the CNS movement to 10% of the motion from a glued larva and allows motion of only 10 ± 30 μm over 350 s immobilization which was sufficient for CNS imaging. These larva-on-a-chip platforms can be useful for studying CNS responses to sensory cues such as sound, light, chemosensory, tactile, and electric/magnetic fields.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,004

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0010,000
Intégrité de la recherche0,0010,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,028
Tête enseignante GPT0,274
Écart entre enseignants0,247 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations14
Publié2017
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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