Sex-specific effect of CPB2 Ala147Thr but not Thr325Ile variants on the risk of venous thrombosis: A comprehensive meta-analysis
Notice bibliographique
Résumé
BACKGROUND: Thrombin activatable fibrinolysis inhibitor (TAFI), encoded by the Carboxypeptidase B2 gene (CPB2), is an inhibitor of fibrinolysis and plays a role in the pathogenesis of venous thrombosis. Experimental findings support a functional role of genetic variants in CPB2, while epidemiological studies have been unable to confirm associations with risk of venous thrombosis. Sex-specific effects could underlie the observed inconsistent associations between CPB2 genetic variants and venous thrombosis. METHODS: A comprehensive literature search was conducted for associations between Ala147Thr and Thr325Ile variants with venous thrombosis. Authors were contacted to provide sex-specific genotype counts from their studies. Combined and sex-specific random effects meta-analyses were used to estimate a pooled effect estimate for primary and secondary genetic models. RESULTS: A total of 17 studies met the inclusion criteria. A sex-specific meta-analysis applying a dominant model supported a protective effect of Ala147Thr on venous thrombosis in females (OR = 0.81, 95%CI: 0.68,0.97; p = 0.018), but not in males (OR = 1.06, 95%CI:0.96-1.16; p = 0.263). The Thr325Ile did not show a sex-specific effect but showed variation in allele frequencies by geographic region. A subgroup analysis of studies in European countries showed decreased risk, with a recessive model (OR = 0.83, 95%CI:0.71-0.97, p = 0.021) for venous thrombosis. CONCLUSIONS: A comprehensive literature review, including unpublished data, provided greater statistical power for the analyses and decreased the likelihood of publication bias influencing the results. Sex-specific analyses explained apparent discrepancies across genetic studies of Ala147Thr and venous thrombosis. While, careful selection of genetic models based on population genetics, evolutionary and biological knowledge can increase power by decreasing the need to adjust for testing multiple models.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,009 | 0,015 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,003 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,013 | 0,051 |
| Bibliométrie | 0,004 | 0,006 |
| Études des sciences et des technologies | 0,001 | 0,001 |
| Communication savante | 0,003 | 0,001 |
| Science ouverte | 0,002 | 0,001 |
| Intégrité de la recherche | 0,002 | 0,002 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,004 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».