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Enregistrement W2618891179 · doi:10.1093/hmg/ddx197

Altered organization of the intermediate filament cytoskeleton and relocalization of proteostasis modulators in cells lacking the ataxia protein sacsin

2017· article· en· W2618891179 sur OpenAlexafffundabout
Emma J. Duncan, Roxanne Larivière, Teisha Y. Bradshaw, Fabiana Longo, Nicolas Sgarioto, Matthew J. Hayes, Lisa E. L. Romano, Suran Nethisinghe, Paola Giunti, Michaela Bruntraeger, Heather D. Durham, Bernard Brais, Francesca Maltecca, Benoît J. Gentil, J. Paul Chapple

Notice bibliographique

RevueHuman Molecular Genetics · 2017
Typearticle
Langueen
DomaineNeuroscience
ThématiqueGenetic Neurodegenerative Diseases
Établissements canadiensMcGill UniversityMontreal Neurological Institute and Hospital
Organismes subventionnairesBiotechnology and Biological Sciences Research CouncilCanadian Institutes of Health ResearchBarts Charity
Mots-clésBiologyIntermediate filamentCell biologyVimentinProteostasisAutophagyLysosomeUbiquitinProteasomeCytoskeletonAggresomeVacuoleNeurofilamentCellGeneticsBiochemistryGeneCytoplasmApoptosisImmunology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Autosomal Recessive Spastic Ataxia of Charlevoix-Saguenay (ARSACS) is caused by mutations in the gene SACS, encoding the 520 kDa protein sacsin. Although sacsin's physiological role is largely unknown, its sequence domains suggest a molecular chaperone or protein quality control function. Consequences of its loss include neurofilament network abnormalities, specifically accumulation and bundling of perikaryal and dendritic neurofilaments. To investigate if loss of sacsin affects intermediate filaments more generally, the distribution of vimentin was analysed in ARSACS patient fibroblasts and in cells where sacsin expression was reduced. Abnormal perinuclear accumulation of vimentin filaments, which sometimes had a cage-like appearance, occurred in sacsin-deficient cells. Mitochondria and other organelles were displaced to the periphery of vimentin accumulations. Reorganization of the vimentin network occurs in vitro under stress conditions, including when misfolded proteins accumulate. In ARSACS patient fibroblasts HSP70, ubiquitin and the autophagy-lysosome pathway proteins Lamp2 and p62 relocalized to the area of the vimentin accumulation. There was no overall increase in ubiquitinated proteins, suggesting the ubiquitin-proteasome system was not impaired. There was evidence for alterations in the autophagy-lysosome pathway. Specifically, in ARSACS HDFs cellular levels of Lamp2 were elevated while levels of p62, which is degraded in autophagy, were decreased. Moreover, autophagic flux was increased in ARSACS HDFs under starvation conditions. These data show that loss of sacsin effects the organization of intermediate filaments in multiple cell types, which impacts the cellular distribution of other organelles and influences autophagic activity.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,164
Score d'incertitude au seuil0,398

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0010,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,021
Tête enseignante GPT0,261
Écart entre enseignants0,240 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations66
Publié2017
Routes d'admission3
Résumé présentoui

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