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Enregistrement W2618913536 · doi:10.1038/ncomms15481

Protein-altering and regulatory genetic variants near GATA4 implicated in bicuspid aortic valve

2017· article· en· W2618913536 sur OpenAlexaff
Bo Yang, Wei Zhou, Jiao Jiao, Jonas B. Nielsen, Michael R. Mathis, Mahyar Heydarpour, Guillaume Lettre, Lasse Folkersen, Siddharth K. Prakash, Claudia Schurmann, Lars G. Fritsche, G.A. Farnum, Maoxuan Lin, Mohammad Othman, Whitney Hornsby, Anisa Driscoll, Alexandra Levasseur, Marc A. Thomas, Linda Farhat, Marie‐Pierre Dubé, Eric M. Isselbacher, Anders Franco‐Cereceda, Dongchuan Guo, Erwin P. Böttinger, G. Michael Deeb, Anna M. Booher, Sachin Kheterpal, Y. Eugene Chen, Hyun Min Kang, Jacob O. Kitzman, Heather J. Cordell, Bernard Keavney, Judith A. Goodship, Santhi K. Ganesh, Gonçalo R. Abecasis, Kim A. Eagle, Alan P. Boyle, Ruth J. F. Loos, Per Eriksson, Jean‐Claude Tardif, Chad M. Brummett, Dianna M. Milewicz, Simon C. Body, Cristen J. Willer

Notice bibliographique

RevueNature Communications · 2017
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueCongenital heart defects research
Établissements canadiensUniversité de MontréalMontreal Heart Institute
Organismes subventionnairesNational Center for Advancing Translational SciencesNational Cancer InstituteNIH Office of the DirectorNational Human Genome Research InstituteNational Institute of Mental HealthNational Heart, Lung, and Blood InstituteWalter Reed National Military Medical CenterNational Institutes of HealthH. Lundbeck A/SUniversity of OxfordNational Institute of Neurological Disorders and StrokeBritish Heart FoundationSeconda Università degli Studi di NapoliBroad InstituteCommon FundUniversity of Texas Health Science Center at HoustonUniversität HamburgUniversity of MiamiIcahn School of Medicine at Mount SinaiVanderbilt UniversityUniversity of ChicagoUniversity of TasmaniaHarvard UniversityUniversity of MichiganHjerteforeningenFundació Institut de Recerca Hospital Universitari Vall d’HebronUniversité de GenèveFonden til Lægevidenskabens FremmeHebrew University of JerusalemFondation LeducqNational Institute on Drug AbuseUniversity of PennsylvaniaUniversità degli Studi di Napoli Federico IILundbeckfondenA.P. Møller og Hustru Chastine Mc-Kinney Møllers Fond til almene FormaalAndrea and Charles Bronfman PhilanthropiesThoracic Surgery Foundation for Research and Education
Mots-clésGATA4Bicuspid aortic valveInduced pluripotent stem cellTranscription factorBiologyHeart developmentHeart valveInternal medicineGeneAortic valveGeneticsMedicineEmbryonic stem cell

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Bicuspid aortic valve (BAV) is a heritable congenital heart defect and an important risk factor for valvulopathy and aortopathy. Here we report a genome-wide association scan of 466 BAV cases and 4,660 age, sex and ethnicity-matched controls with replication in up to 1,326 cases and 8,103 controls. We identify association with a noncoding variant 151 kb from the gene encoding the cardiac-specific transcription factor, GATA4, and near-significance for p.Ser377Gly in GATA4. GATA4 was interrupted by CRISPR-Cas9 in induced pluripotent stem cells from healthy donors. The disruption of GATA4 significantly impaired the transition from endothelial cells into mesenchymal cells, a critical step in heart valve development.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,934
Score d'incertitude au seuil0,462

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0010,001
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,022
Tête enseignante GPT0,338
Écart entre enseignants0,316 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations128
Publié2017
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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