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Enregistrement W2619187656 · doi:10.1002/jrsm.1243

Evaluating the accuracy and economic value of a new test in the absence of a perfect reference test

2017· article· en· W2619187656 sur OpenAlexaffabout
Xuanqian Xie, Alison Sinclair, Nandini Dendukuri

Notice bibliographique

RevueResearch Synthesis Methods · 2017
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueBacterial Identification and Susceptibility Testing
Établissements canadiensMcGill UniversityMcGill University Health CentreUniversity of Toronto
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésTest (biology)MedicineConfidence intervalDiagnostic testDiagnostic accuracyComputer scienceStatisticsInternal medicineMathematicsPediatrics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

BACKGROUND: Streptococcus pneumoniae (SP) pneumonia is often treated empirically as diagnosis is challenging because of the lack of a perfect test. Using BinaxNOW-SP, a urinary antigen test, as an add-on to standard cultures may not only increase diagnostic yield but also increase costs. OBJECTIVE: To estimate the sensitivity and specificity of BinaxNOW-SP and subsequently estimate the cost-effectiveness of adding BinaxNOW-SP to the diagnostic work-up. DESIGN: We fit a Bayesian latent-class meta-analysis model to obtain estimates of BinaxNOW-SP accuracy that adjust for the imperfect accuracy of culture. Meta-analysis results were combined with information on prevalence of SP pneumonia to estimate the number of patients who are correctly classified under competing diagnostic strategies. Taking into consideration the cost of antibiotics, we determined the incremental cost of adding BinaxNOW-SP to the work-up per case correctly diagnosed. RESULTS: The BinaxNOW-SP test had a pooled sensitivity of 0.74 (95% credible interval [CrI], 0.67-0.83) and a pooled specificity of 0.96 (95% CrI, 0.92-0.99). An overall increase in diagnostic accuracy of 6.2% due to the addition of BinaxNOW-SP corresponded to an incremental cost per case correctly classified of $582 Canadian dollars. CONCLUSIONS: The methods we have described allow us to evaluate the accuracy and economic value of a new test in the absence of a perfect reference test using an evidence-based approach.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,114
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,302
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesMétarecherche
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: Méthodes · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Théorique ou conceptuel · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Méthodes · Signal consensuel: aucune
Score de désaccord entre enseignants0,886
Score d'incertitude au seuil0,601

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,1140,302
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0020,001
Méta-épidémiologie (sens large)0,0050,013
Bibliométrie0,0060,004
Études des sciences et des technologies0,0000,002
Communication savante0,0050,003
Science ouverte0,0030,002
Intégrité de la recherche0,0050,003
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,344
Tête enseignante GPT0,558
Écart entre enseignants0,213 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Devis d'étudeThéorique ou conceptuel
DomaineMéthodes
GenreMéthodes

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations16
Publié2017
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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