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Enregistrement W2619541291 · doi:10.1371/journal.pntd.0005562

Epitope mapping of recombinant Leishmania donovani virulence factor A2 (recLdVFA2) and canine leishmaniasis diagnosis using a derived synthetic bi-epitope

2017· article· en· W2619541291 sur OpenAlexfundno aff
Eric Henrique Roma, Fernanda Costal-Oliveira, Lucas de Carvalho Dhom-Lemos, Cristina Monerat Toledo-Machado, Oscar Bruña–Romero, Daniella Castanheira Bartholomeu, Ricardo Toshio Fujiwara, Carlos Chávez-Olórtegui

Notice bibliographique

RevuePLoS neglected tropical diseases · 2017
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueResearch on Leishmaniasis Studies
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesUniversidade Federal de Minas GeraisFundação de Amparo à Pesquisa do Estado de Minas GeraisConselho Nacional de Desenvolvimento Científico e TecnológicoGoverno BrasilCoordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível SuperiorMcGill University
Mots-clésEpitopeVisceral leishmaniasisLeishmania donovaniVirologyEpitope mappingMonoclonal antibodyBiologyAntigenLeishmaniasisLeishmaniaImmunogenLinear epitopeRecombinant DNAAntibodyVirulence factorVirulenceImmunologyParasite hostingBiochemistry

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

BACKGROUND: Leishmaniasis is one of the most important zoonotic diseases spread in Latin America. Since many species are involved in dog infection with different clinical manifestations, the development of specific diagnostic tests is mandatory for more accurate disease control and vaccine strategies. METHODOLOGY/PRINCIPAL FINDINGS: Seventy-five 15-mer peptides covering the sequence of recombinant Leishmania donovani virulence factor A2 (recLdVFA2) protein were prepared by Spot synthesis. Membrane-bound peptides immunoreactivity with sera from dogs immunized with recLdVFA2 and with a specific anti-recLdVFA2 monoclonal antibody allowed mapping of continuous B-cell epitopes. Five epitopes corresponding to the N-terminal region of recLdVFA2 (MKIRSVRPLVVLLVC, RSVRPLVVLLVCVAA, RPLVVLLVCVAAVLA, VVLLVCVAAVLALSA and LVCVAAVLALSASAE, region 1-28) and one located within the repetitive units (PLSVGPQAVGLSVG, regions 67-81 and 122-135) were identified. A 34-mer recLdVFA2-derived bi-epitope containing the sequence MKIRSVRPLVVLLVC linked to PLSVGPQAVGLSVG by a Gly-Gly spacer was chemically synthesized in its soluble form. The synthetic bi-epitope was used as antigen to coat ELISA plates and assayed with dog sera for in vitro diagnosis of canine visceral leishmaniasis (CVL). The assay proved to be highly sensitive (98%) and specific (99%). CONCLUSIONS/SIGNIFICANCE: Our work suggests that synthetic peptide-based ELISA strategy may be useful for the development of a sensitive and highly specific serodiagnosis for CVL or other parasitic diseases.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,002

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,063
Tête enseignante GPT0,305
Écart entre enseignants0,242 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations19
Publié2017
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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