EPND-08. EPIGENETIC H3K27ME3 DEREGULATION IN PEDIATRIC POSTERIOR FOSSA EPENDYMOMAS
Notice bibliographique
Résumé
Ependymomas in children occur most commonly in the posterior fossa of the brain and cause significant morbidity and mortality. The pathogenesis of these tumors remains obscure as recent whole genome and whole exome sequencing efforts have not yielded recurrent genetic mutations. These tumors exhibit abnormal CpG island methylation, suggesting that epigenetic alterations may be a significant driver. To gain insights into the epigenetics of childhood ependymomas, we performed mass spectroscopy for histone modifications to discover that H3K27 trimethylation was globally reduced in these tumors. Despite global reduction in H3K27me3, ChIP-sequencing for H3K27me3 revealed genomic enrichment at several loci important for neurodevelopment. In a cohort of 195 childhood posterior fossa ependymoma samples, reduction in H3K27me3 was associated with worse prognosis (p<0.0001). Comparison of DNA methylation and genome-wide H3K27me3 enrichment from both H3K27M mutant diffuse intrinsic pontine gliomas and childhood ependymomas patient samples showed many similarities and pointed to factors that regulate radial glial (neuronal stem cells) development. Human radial glial cells during development exhibit low H3K27me3. Ependymomas with reduced H3K27me3 corresponded to younger children (p<0.0001), arose mainly from the roof of the forth ventricle, exhibited increased evidence of radiologic and histopathologic invasion and exhibited clinical features consistent with previously described PFA subgroup of ependymomas. Together these data suggest that the epigenetics of the developing posterior fossa are closely related to the pathogenesis of childhood brain tumors and have clinical implications for biomarker development and to inform epigenetic approaches to treat PF ependymomas.
Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.
Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,002 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».