The role of the innate immune response regulatory gene ABCF1 in mammalian embryogenesis and development
Notice bibliographique
Résumé
ABCF1 is an ABC transporter family protein that has been shown to regulate innate immune response and is a risk gene for autoimmune pancreatitis and arthritis. Unlike other members of ABC transporter family, ABCF1 lacks trans-membrane domains and is thought to function in translation initiation through an interaction with eukaryotic translation initiation factor 2 (eIF2). To study ABCF1 expression and function in development and disease, we used a single gene trap insertion in the Abcf1 gene in murine embryonic stem cells (ES cells) that allowed lineage tracing of the endogenous Abcf1 promoter by following the expression of a β-galactosidase reporter gene. From the ES cells, heterozygous mice (Abcf1+/-) were produced. No live born Abcf1-/- progeny were ever generated, and the lethality was not mouse strain-specific. Thus, we have determined that Abcf1 is an essential gene in development. Abcf1-/- mice were found to be embryonic lethal at 3.5 days post coitum (dpc), while Abcf1+/- mice appeared developmentally normal. Abcf1+/- mice were fertile and showed no significant differences in their anatomy when compared with their wild type littermates. The Abcf1 promoter was found to be active in all organs in adult mice, but varies in levels of expression in specific cell types within tissues. Furthermore, we observed high promoter activity in the blastocysts and embryos. Overall, Abcf1 expression in embryos is required for development and its expression in adults was highly correlated with actively proliferating and differentiating cell types.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,001 |
| Communication savante | 0,001 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,001 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».