A novel GoldNano Carb test for rapid phenotypic detection of carbapenemases, particularly OXA type, in Enterobacteriaceae, Pseudomonas aeruginosa and Acinetobacter spp.
Notice bibliographique
Résumé
Objectives: To develop a simple gold nanoparticle (AuNP)-based colorimetric test, GoldNano Carb (GoldC), for detecting carbapenemase production in Gram-negative bacteria, compared with updated Carba NP (CNP) and CarbAcineto NP (CAcNP) tests by using PCR methods as gold standard. Methods: Ninety-nine carbapenemase-producing Enterobacteriaceae (CPE), Pseudomonas spp. and Acinetobacter spp. isolates and 89 non-CPE isolates were tested by the GoldC and CNP. Additionally, the CAcNP was performed in the Acinetobacter spp. isolates. The final imipenem (imipenem/cilastatin form) concentration was 5 mg/mL for all three tests. For the GoldC, the imipenem powder was added directly to bacterial cell suspension in distilled water prior to detection of acid product by the citrate-capped AuNP solution. An AuNP change from red to purple, blue or green indicates carbapenemase activity. Results: The GoldC detected all carbapenemase producers except one OXA-23-like producer (99.0% sensitivity), whereas 11 carbapenemase producers (10 Acinetobacter and 1 P. aeruginosa) were CNP negative (88.9% sensitivity). However, the GoldC and CNP provided 100% and 98.6% sensitivity, respectively, for the CPE and Pseudomonas spp. Both tests gave one false positive from CTX-M-1-like-producing Enterobacter spp. (98.9% specificity). The GoldC and CAcNP detected 96.7% and 93.3% of the Acinetobacter spp. isolates, respectively. Interestingly, times to positivity by the GoldC were markedly shorter than those by the CNP (76.8% versus 36.2% positive at 5 min) and CAcNP (43.3% at 5 min versus 20% within 30 min). Conclusions: The GoldC is fast, easy, highly sensitive and inexpensive (∼$0.25 per test), suggesting that it may be suitable for routine carbapenemase detection in low-resource settings for infection control or epidemiological purposes.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,001 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,001 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,001 | 0,001 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,001 |
| Communication savante | 0,001 | 0,001 |
| Science ouverte | 0,001 | 0,001 |
| Intégrité de la recherche | 0,002 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,002 | 0,001 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».