Comparison of the fecal bacterial microbiota of healthy and diarrheic foals at two and four weeks of life
Pourquoi ce travail est dans la base
Une base qui oublie comment elle a trouvé un travail ne peut pas être vérifiée. Voici les voies qui ont admis celui-ci.
Notice bibliographique
Résumé
BACKGROUND: Diarrhea in foals affects up to 60% of foals during the first six months of life. The effect of diarrhea on the fecal bacterial microbiota in foals has not been investigated. Little is known on the fecal bacterial microbial richness and diversity of foals at a young age. The objective was to compare the fecal bacterial microbiota of healthy foals to foals with diarrhea at two and four weeks of life. METHODS: Fecal samples were collected from foals (n = 20) at 1-14 (T1) and 15-28 (T2) days of age and analyzed using high throughput sequencing. Differences in relative abundance of bacterial taxa, alpha diversity and beta diversity indices were assessed between age-matched foals with diarrhea (n = 9) and healthy foals (n = 11), and between time points. RESULTS: Differences in microbial community composition based on time point and health status were observed on all taxonomic levels. Of 117 enriched species in healthy foals at T2, 50 (48%) were Lachnospiraceae or Ruminococcaceae. The Chao richness index was increased in healthy foals at T2 compared to T1 (p = 0.02). Foals with diarrhea had a significantly lower richness index than non-diarrheic foals at T2 (p = 0.04). Diarrhea had an inconsistent effect, while time point had a consistent effect on microbial community structure. CONCLUSIONS: Preventative and therapeutic measures for diarrhea should focus on maintaining bacterial microbiota richness. Lachnospiraceae and Ruminococcaceae were underrepresented in foals with diarrhea. These should be evaluated further as potential therapeutic options.
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Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,004 | 0,003 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,001 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,001 | 0,004 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,002 | 0,007 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle