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Enregistrement W2620729712 · doi:10.1093/infdis/jix273

The EVVA Cohort Study: Anal and Cervical Type-Specific Human Papillomavirus Prevalence, Persistence, and Cytologic Findings in Women Living With HIV

2017· article· en· W2620729712 sur OpenAlexaffabout
Alexandra de Pokomandy, Elaina Kaufman, Cristina De Castro, Marie‐Hélène Mayrand, Ann N. Burchell, Marina B. Klein, Louise Charest, Manon Auger, Sophie Rodrigues‐Coutlée, François Coutlée, Pierre Côté, Lina Del Balso, Mylène Fernet, Georges Ghattas, R Lalonde, Raymond P. LeBlanc, Bernard Lessard, Mona Loutfy, Victoria Marcus, MH Mayrand, Marie Muňoz, Martin Potter, Helen Preziosi, Danielle Rouleau, Routy Jp, Helen Trottier, Tyler Williamson

Notice bibliographique

RevueThe Journal of Infectious Diseases · 2017
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueCervical Cancer and HPV Research
Établissements canadiensPublic Health OntarioUniversity of TorontoUniversité de MontréalCentre Hospitalier de l’Université de MontréalMcGill UniversityUniversity of CalgaryMcGill University Health Centre
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésMedicineAnal cancerGenotypingGynecologyCervical cancerPopulationCohortAnal canalHPV infectionObstetricsPapillomaviridaeHuman papillomavirusGenotypeInternal medicineCancerRectumBiologyGenetics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Background: The risk of anal cancer due to high-risk human papillomavirus (HR-HPV) is higher in women living with human immunodeficiency virus (HIV) than in the general population. We present findings of cervical and anal HPV and cytologic tests at baseline in the EVVA cohort study and HPV persistence data 6 months after baseline. Methods: Semiannual visits included questionnaires, chart reviews, cervical/anal cytologic and cervical/anal HPV testing for 2 years. Genotyping for 36 HPV genotypes was performed using the Roche Linear Array HPV genotyping test. Results: A total of 151 women living with HIV were recruited. At baseline, 75% had anal HPV, 51% had anal HR-HPV, 50% had cervical HPV, and 29% had cervical HR-HPV. Anal HPV-16 and HPV-51 were more frequent in women born in Canada (31% and 29%, respectively, compared with ≤16% for other women). Most anal HR-HPV types detected at 6 months (57%-93%) were persistent from baseline. Findings of anal cytologic tests were abnormal for 37% of women. Conclusions: Anal HPV is highly prevalent in women living with HIV, and type distribution varies by place of birth. High-resolution anoscopy was indicated in more than one third of results. As anal cancer is potentially preventable, these important findings need to be considered when selecting the best approach for anal cancer screening programs.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,002
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,008
Score d'incertitude au seuil0,016

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,002
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0010,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0010,000
Science ouverte0,0010,001
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,025
Tête enseignante GPT0,308
Écart entre enseignants0,283 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations16
Publié2017
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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