WhiB4 Regulates the PE/PPE Gene Family and is Essential for Virulence of Mycobacterium marinum
Notice bibliographique
Résumé
During the course of infection, pathogenic mycobacteria including Mycobacterium tuberculosis (M. tb) encounter host environments of variable oxygen tension, ranging from the hypoxic center of granulomas to the most oxygenated region in the lung cavities. Mycobacterial responses to changes of oxygen tension are critically related to infection outcomes, such as latency and reactivation. WhiB4 is an iron-sulfur containing transcription factor that is highly sensitive to oxygen exposure. In this study, we found that WhiB4 of Mycobacterium marinum (M. marinum), a pathogenic mycobacterial species that is closely related to M. tb, is required for its virulence. M. marinum ΔwhiB4 exhibited defective intracellular replication in macrophages and diminished virulence in zebrafish. Histology analysis revealed that the host had successfully controlled ΔwhiB4 bacteria, forming well-organized granulomas. RNA-seq analysis identified a large number of pe/ppe genes that were regulated by WhiB4, which provides an explanation for the essential role of WhiB4 in M. marinum virulence. Several antioxidant enzymes were also upregulated in ΔwhiB4, supporting its role in modulation of oxidative stress response. Taken together, we have provided new insight into and proposed a model to explain the physiological role of WhiB4.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,001 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,002 | 0,001 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».