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Enregistrement W2620885574 · doi:10.1017/cjn.2017.71

A.07 Genomics of atypical dyskinetic cerebral palsy – opportunities for improved diagnosis and management

2017· article· en· W2620885574 sur OpenAlexaffvenue
Helly Goez, A.W. Matthews, B Al Jabri, Ingrid Blydt-Hansen, Johan Hviid Andersen, Maja Tarailo‐Graovac, Britt I. Drögemöller, Casper Shyr, J Lee, Abdul Rahman Izaini Ghani, Graham Sinclair, Cole Ross, Wyeth W. Wasserman, Marie McKinnon, G Horváth, Clara van Karnebeek

Notice bibliographique

RevueCanadian Journal of Neurological Sciences / Journal Canadien des Sciences Neurologiques · 2017
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueMetabolism and Genetic Disorders
Établissements canadiensVancouver Biotech (Canada)Alberta Hospital Edmonton
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésDystoniaExome sequencingMedicineChoreoathetosisAthetosisPediatricsAtaxiaMovement disordersCerebral palsyHypotoniaMedical diagnosisEpilepsyChoreaPhysical medicine and rehabilitationBioinformaticsPsychiatryGeneticsInternal medicinePathologyBiologyMutationGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Background: Cerebral palsy (CP) is a debilitating disorder (1). Based on neuromotor impairments it is divided to spastic, dyskinetic and ataxic types (2). Inborn Errors of Metabolism (IEMs), monogenic and chromosomal disorders mimic CP (3). We aimed to identify causal genetic variants in patients with atypical dyskinetic CP in whom known IEMs were ruled out. Timely diagnosis is essential for proper management, especially in conditions that mimic CP and are treatable. Methods: We enrolled 23 patients with unexplained atypical dyskinetic CP, for whole exome sequencing. Variants were filtered against public and in-house databases to identify variants predicted as damaging (in silico tools and ACMG criteria). We applied a virtual gene panel of known and suspected CP and movement disorder genes and investigated each sample. Results: The participants presented with symptoms including: spasticity, dystonia, choera-athetosis, ataxia and cognitive delays. We identified 23 diagnoses: 13 dominant,6 recessive and 4 X-linked. 12 patients had movement disorders. In 4, the diagnoses enabled targeted treatment (neurotransmitter supplements in Unverricht Lundborg diseases (CSTB) and PAK3 deficiency, deep brain stimulation in GNAO1 deficiency, medical diet in Glutaric Aciduria (GCDH). Conclusions: Whole Exome Sequencing contributes to establishing diagnosis in patients with atypical dyskinetic CP resulting in precision medicine and improved health outcomes.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,002
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,003
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Sans objet · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Synthèse · Signal consensuel: aucune
Score de désaccord entre enseignants0,014
Score d'incertitude au seuil0,046

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0020,003
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,000
Bibliométrie0,0010,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0020,001
Science ouverte0,0010,001
Intégrité de la recherche0,0010,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0140,003

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,049
Tête enseignante GPT0,272
Écart entre enseignants0,222 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeSans objet
Domainenon disponible
GenreSynthèse

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2017
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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