High-resolution crystal structures and STD NMR mapping of human ABO(H) blood group glycosyltransferases in complex with trisaccharide reaction products suggest a molecular basis for product release
Notice bibliographique
Résumé
The human ABO(H) blood group A- and B-synthesizing glycosyltransferases GTA and GTB have been structurally characterized to high resolution in complex with their respective trisaccharide antigen products. These findings are particularly timely and relevant given the dearth of glycosyltransferase structures collected in complex with their saccharide reaction products. GTA and GTB utilize the same acceptor substrates, oligosaccharides terminating with α-l-Fucp-(1→2)-β-d-Galp-OR (where R is a glycolipid or glycoprotein), but use distinct UDP donor sugars, UDP-N-acetylgalactosamine and UDP-galactose, to generate the blood group A (α-l-Fucp-(1→2)[α-d-GalNAcp-(1→3)]-β-d-Galp-OR) and blood group B (α-l-Fucp-(1→2)[α-d-Galp-(1→3)]-β-d-Galp-OR) determinant structures, respectively. Structures of GTA and GTB in complex with their respective trisaccharide products reveal a conflict between the transferred sugar monosaccharide and the β-phosphate of the UDP donor. Mapping of the binding epitopes by saturation transfer difference NMR measurements yielded data consistent with the X-ray structural results. Taken together these data suggest a mechanism of product release where monosaccharide transfer to the H-antigen acceptor induces active site disorder and ejection of the UDP leaving group prior to trisaccharide egress.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».