Application of Euclidean distance mapping for assessment of basement membrane thickness distribution in asthma
Notice bibliographique
Résumé
Abnormal thickening of the airway basement membrane is one of the hallmarks of airway remodeling in asthma. The present protocols for measuring the basement membrane involve the use of stained tissue sections and measurements of the basement membrane thickness at certain intervals, followed by the calculation of the geometric mean thickness for each airway. This report describes an automated, unbiased approach which uses color segmentation to identify structures of interest on stained sections and Euclidean distance mapping to measure the thickness distribution of airway structures. This method was applied to study the thickness distribution of the basement membrane and airway epithelium in lungs donated for research from seven nonasthmatic and eight asthmatic age- and sex-matched donors. A total of 60 airways were assessed. We report that the thickness and thickness distribution of the basement membrane and airway epithelium are increased in large and small airways of asthmatics compared with nonasthmatics. Using this method we were able to demonstrate the heterogeneity in the thickness of the basement membrane and airway epithelium within individual airways of asthmatic subjects. This new computational method enables comprehensive and objective quantification of airway structures, which can be used to quantify heterogeneity of airway remodeling in obstructive lung diseases such as asthma and chronic obstructive pulmonary disease. NEW & NOTEWORTHY The described application of Euclidean distance mapping provides an unbiased approach to study the extent and thickness distribution of changes in tissue structures. This approach will enable researchers to use computer-aided analysis of structural changes within lung tissue to understand the heterogeneity of airway remodeling in lung diseases.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,002 | 0,003 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,002 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,001 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,001 | 0,001 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».