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Enregistrement W2622113037

Kallikrein 6 as a biomarker for the detection of metastatic cancer cells in blood of ovarian cancer patients

2004· article· en· W2622113037 sur OpenAlexaff
Katerina Economopoulou, Eleftherios P. Diamandis

Notice bibliographique

RevueCancer Research · 2004
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueCoagulation, Bradykinin, Polyphosphates, and Angioedema
Établissements canadiensUniversity of TorontoMount Sinai Hospital
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésKallikreinOvarian cancerCancerProstate cancerBiologyCancer researchProteasesBiomarkerMetastasisMolecular biologyEnzymeGeneticsBiochemistry
DOInon disponible

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Proc Amer Assoc Cancer Res, Volume 45, 2004 1058 Kallikreins are a family of secreted serine proteases that have been recently discovered and seem to associate with cancer. The genetic locus of these proteases lies at 19q13.3-13.4. Human Kallikrein 6 (hK6) is a member of this protein family and it is encoded by KLK6 gene. We have previously found that hK6 is elevated in the serum of ovarian cancer patients and over-expression of hK6 tended to be greater at later stages of the disease. These findings suggest a potential role of serum hK6 concentration as a biomarker for ovarian cancer. This present study aims to utilize KLK6 gene transcripts for the detection of disseminated ovarian cancer cells in blood. Previous studies on ovarian, prostate and breast cancer patients, using molecular markers, have detected circulating metastatic cancer cells. In some cases, the methods show high sensitivity and detect metastatic cells at a ratio of around 1 metastatic cell to106 cells not expressing the marker gene. We first identified a cancer cell line, PC3(AR6), that strongly expresses KLK6 and another cell line, ES2, that does not express KLK6. To determine the detection limit of our method we diluted KLK6 transcripts (KLK6-pBluescript plasmid) up to 1 transcript per reaction. Using KLK6 as a marker and Polymerase Chain Reaction (PCR), we were able to detect around 10 transcripts per reaction. We also diluted the PC3(AR6) cells up to 1 cell and using Reverse Transcription PCR (RT-PCR) we were able to detect less than 1 PC3(AR6) cell per reaction. We then mixed PC3(AR6) cells with ES2 cells in ratios up to 1:106. Using RT-PCR, we were able to detect less than 1 PC3(AR6) cell per reaction. We can conclude that we have developed a highly sensitive method for monitoring KLK6 mRNA and cells expressing this gene. In the future we will examine if this technology can detect circulating ovarian cancer cells for the purpose of disease diagnosis and prognosis.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,002
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,002
Score d'incertitude au seuil0,005

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,002
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0010,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,078
Tête enseignante GPT0,401
Écart entre enseignants0,323 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2004
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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